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Enregistrement W7028598539

Evolving networks as coupled differential equations: a phenotypic model of Dipterans during embryogenesis

2017· dissertation· en· W7028598539 sur OpenAlexaff

Notice bibliographique

RevueeScholarship@McGill (McGill) · 2017
Typedissertation
Langueen
DomaineArts and Humanities
ThématiqueArt, Technology, and Culture
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPhenotypeGeneGene regulatory networkSegmentationSet (abstract data type)Genetic networkPhylogeneticsDifferential (mechanical device)
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABR ÉG ÉUn réseau complexe de gènes définit le profil génétique selon l'axe antéro-postérieur de certains individus de la famille des diptères et établit un modèle robuste qui diffère légèrement entre les espèces.Les différences dans la configuration spatiale des gènes de segmentation de Drosophila et Anopheles suggèrent que les paramètres définissant leurs réseaux ont évolué différemment à partir de leur dernier ancêtre commun.L'étude du réseau, défini par un ensemble d'équations différentielles, en utilisant notre algorithme génétique révèle une trajectoire phénotypique qui explique ces différences tout en conservant des conditions nécessaires pour garder des espèces viables pendant l'évolution.Cette recherche à travers un "hyperespace" de paramètres en utilisant l'algorithme génétique prédit des homologies entre les différents modules contrôlant les bandes de gène cible invariant eve.De plus, un modèle de réseau est développé pour expliquer la polarité du motif de gènes de segmentation exprimés dans l'embryon, ce qui suggère que cette éspèce ancestrale exploitait un réseau dynamique pour établir un motif périodique des autres gènes de segmentation par rapport à eve.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,013
Score d'incertitude au seuil0,025

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,233
Écart entre enseignants0,209 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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