Functional analysis of Prolyl Hydroxylase X in drug resistance
Notice bibliographique
Résumé
A novel gene, named as the PHDX gene, had been previously identified while screening genes for their involvement in resistance to the chemotherapeutic drug etoposide and to hydrogen peroxide, using the methodology of retrovirus promoter trap mutagenesis. This study was undertaken for the purpose of testing whether the loss of PHDX gene is responsible for drug resistance in CHO-E-126 cell line which was created from Chinese hamster ovary cells having a retroviral receptor and selected for etoposide resistance. The PHDX gene resides on mouse chromosome 11 and has homology with the prolyl hydroxylase gene family. We hypothesized that the inactivation of the PHDX gene by promoter trap mutagenesis will confer resistance to etoposide and hydrogen peroxide in the E-126 cell line. In addition, the alteration of the cellular hydroxyproline levels by the loss of the gene might influence the drug response through the production of oxygen free radicals. To study the involvement of the PHDX gene in etoposide and hydrogen peroxide induced drug-resistance, we used two experimental approaches to modulate the function of the gene in cells. First, we silenced the expression of this gene by RNA interference (RNAi) through stable and transient knockdown experiments in the parental Chinese hamster ovary (CHO-K1)cells, and second, we overexpressed the gene in CHO-Cl-22 and CHO-E-126 cells. We assessed the effect of the knockdown by RT-PCR. The effect of etoposide and hydrogen peroxide was determined by the clonogenic crystal violet staining assay and the MTT assay. Through our siRNAi knockdown studies, we were able to demonstrate the involvement of the gene in drug resistance. We were unable to show that the overexpression of the gene was capable of reverting to the drug sensitive phenotype.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».