Genetic correlates of HIV resistance
Notice bibliographique
Résumé
The Human Immunodeficiency Virus 1 (HIV-1) epidemic continues to claim millions of lives, despite intense research and public health programs. A natural model of resistance is crucial for the development of an effective vaccine. We have identified a group of sex workers in Nairobi, Kenya, who appear to be resistant to infection with HIV. Research on this cohort has identified numerous immunological and genetic correlates to HIV resistance, but has failed to completely explain the phenomenon. Genetic studies have shown that HIV resistance occurs in families, with both sex worker and non-sex worker relatives of HIV resistant women less likely to be HIV infected. In addition, HIV resistance has been associated with altered innate immune responses, as measured by cytokine production to toll-like receptor stimuli. To test the hypothesis that there is a genetic component to HIV resistance, we will address two specific objectives within this thesis: 1) identify known polymorphisms associated with HIV resistance in the kindred of these women; more specifically interferon regulatory factor 1 (IRF-1) polymorphisms, and 2) identify polymorphisms within toll-like receptors (TLRs) that may be responsible for the altered and apparently successful immune responses in HIV resistant women. Our findings show an association between HIV resistant kindred and an IRF-1 microsatellite, as well as, with an IRF-1 single nucleotide polymorphism. No associations were found between HIV resistance and the investigated TLR2 and TLR4 polymorphisms. These results also suggest a genetic component to HIV resistance, but do not fully explain the altered immune responses observed within these women.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,005 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».