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Enregistrement W7028850201

A fourdimensional microscope for single molecule studies in living cells using astigmatic axial resolution enhancement

2015· dissertation· en· W7028850201 sur OpenAlexaff

Notice bibliographique

RevueOxford University Research Archive (ORA) (University of Oxford) · 2015
Typedissertation
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAdvanced Fluorescence Microscopy Techniques
Établissements canadiensTrinity College
Organismes subventionnairesEuropean Commission
Mots-clésNucleofectionProteogenomicsTSG101DiafiltrationTubulopathyHyporeflexia
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

<p>An important part of life is to react to the environment and adapt to it. All living cells rely on chemical cascades that form signal pathways, from stimulus to transcription events at the DNA. To know more about these pathways we need tools to visualise the signals.</p> <p>Here is outlined developmental and experimental work on a bespoke microscope system primarily for fast single molecule tracing of proteins in living eukaryote cells. Both hardware and software has been developed. Frame rates and exposure times have been pushed to match the speed of freely diffusing particles in living cells. An EMCCD camera with an electronic gain of 300x and a 5 ms exposure time at 200 frames per second enables this.</p> <p>An astigmatic axial resolution enhancement approach has been implemented to allow tracking with high precision of single fluorescent proteins in real-time in three dimensions in a comparatively large volume. The high resolution in three spatial dimensions and one temporal aim to meet these demands. Software to extract the additional axial information has been developed that can determine axial displacement with 38 nm precision.</p> <p>The microscope system has proven it can find and track small clusters of YPet fluorescent protein in <em>E. coli</em> at short exposure times.</p>

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,519
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,049
Tête enseignante GPT0,339
Écart entre enseignants0,290 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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