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Enregistrement W7029034776

Hemagglutinin-esterase (HE) from Infectious Salmon Anemia virus (ISAv): Characteristics and attempted expression

2015· dissertation· en· W7029034776 sur OpenAlexaboutno aff

Notice bibliographique

RevueSummit (Simon Fraser University) · 2015
Typedissertation
Langueen
DomaineEngineering
ThématiqueArtificial Immune Systems Applications
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésVirusVirulencePathogenCloning (programming)Host (biology)EsteraseInfectious hematopoietic necrosis virusEquine infectious anemiaImmune system
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Infectious salmon anemia virus (ISAv) is a pathogen that mainly affects Atlantic salmon (Salmo salar), which are commonly grown in the aquaculture industry. The resulting disease, infectious salmon anemia, has caused large financial losses for this industry. ISAv is a member of the Orthomyxoviridae family, as are the influenza type A, B and C viruses, and it belongs to the genus Isavirus. ISAv has a single dual-functional surface protein that is involved in the interaction with the host cells, namely: a hemagglutinin-esterase (HE). The HE protein binds preferentially to 4-O,5-N-diacetylneuraminic acid residues that are present on the target cells, which in this case are salmon erythrocytes. As is the case for influenza, the binding of HE protein to 4-O-acetylsialosides (receptor function) triggers infection in salmon, whereas the esterase active site, which possesses the 'receptor destroying' activity hydrolyzes the 4-O-acetyl groups, aiding the release of the viral progeny to infect neighbouring cells. This thesis reports the cloning and the attempted expression of the haemagglutinin-esterase from two different ISAv strains, that is a Canadian and a Norwegian strain, using baculovirus expression systems.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,218
Écart entre enseignants0,207 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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