Hemagglutinin-esterase (HE) from Infectious Salmon Anemia virus (ISAv): Characteristics and attempted expression
Notice bibliographique
Résumé
Infectious salmon anemia virus (ISAv) is a pathogen that mainly affects Atlantic salmon (Salmo salar), which are commonly grown in the aquaculture industry. The resulting disease, infectious salmon anemia, has caused large financial losses for this industry. ISAv is a member of the Orthomyxoviridae family, as are the influenza type A, B and C viruses, and it belongs to the genus Isavirus. ISAv has a single dual-functional surface protein that is involved in the interaction with the host cells, namely: a hemagglutinin-esterase (HE). The HE protein binds preferentially to 4-O,5-N-diacetylneuraminic acid residues that are present on the target cells, which in this case are salmon erythrocytes. As is the case for influenza, the binding of HE protein to 4-O-acetylsialosides (receptor function) triggers infection in salmon, whereas the esterase active site, which possesses the 'receptor destroying' activity hydrolyzes the 4-O-acetyl groups, aiding the release of the viral progeny to infect neighbouring cells. This thesis reports the cloning and the attempted expression of the haemagglutinin-esterase from two different ISAv strains, that is a Canadian and a Norwegian strain, using baculovirus expression systems.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».