Lampreys adjust, mammals non-plussed, birds robust: how ecological and environmental features influence genetic diversity
Notice bibliographique
Résumé
Evolutionary forces are intrinsically tied to environments and ecosystems species occupy. Gene flow is shaped by conduits and impediments in landscape features and conditions, and spatially separate populations often divergently adapt to heterogenous environments. Understanding the nexus of environments and genetic diversity is vital when managing species, especially in the context of rapid global climate change and increasing anthropogenic disturbance. I used two avenues of study to explore this relationship on large spatial scales. I analyzed whole-genome sequencing data for 209 invasive sea lampreys in the Laurentian Great Lakes, and publicly archived, raw microsatellite data from 1,008 bird and mammal population data points across Canada and the United States. For the former, I hypothesized that as an invasive species recently introduced to a novel environmental gradient, the sea lamprey populations would be locally adapted to conditions in the Great Lakes. For the latter, I hypothesized that the human footprint index (HFI), when used as a resistance surface, would best explain genetic distances in bird and mammal populations in North America. For both studies, I used statistical approaches to look for patterns of genetic diversity among and across populations of animals and identify environmental covariates of these patterns. I found evidence of local adaptation in sea lamprey populations, whereby the adaptive divergence of populations significantly correlated with levels of human population density. Bird and mammal populations were also shaped by human influence, with a positive and negative effect, respectively, of the HFI on genetic distance. Though direction and degree of effects on genetic diversity varied across taxonomic groups, these results indicate the overarching influence environmental variables—particularly, human disturbances—have on spatial distribution and genetic diversity across taxonomic groups. Be it an invasive species, or species of conservation concern, understanding the link between environmental gradients and genetic diversity of animal populations is of both biological and managerial interest.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».