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Enregistrement W7030577336

A numerical study of the effects of multiplicative noise on a supercritical delay induced Hopf bifurcation in a gene expression model /

2006· other· en· W7030577336 sur OpenAlexvenueno aff

Notice bibliographique

RevueLibrary and Archives Canada (Government of Canada) · 2006
Typeother
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGene Regulatory Network Analysis
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHopf bifurcationMultiplicative noiseNonlinear systemConvergence (economics)Noise (video)Stochastic differential equationContext (archaeology)Delay differential equationNumerical analysisMultiplicative function
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In the context of gene expression, we proposed a nonlinear stochastic delay differential equation as a mathematical model to study the effects of extrinsic noise on a delay induced Hopf bifurcation. We envisaged its direct numerical resolution. Following the example of the noisy oscillator, we first solved a linearized version of the equation, close to the Hopf bifurcation. The numerical scheme used is a combination of a standard algorithm to solve a deterministic delay differential equation and a stochastic Euler scheme. From our calculations we verified that the deterministic behaviour is fully recovered. For the stochastic case, we found that our solution is qualitatively accurate, in the sense that the noise induced shift in the critical value a, follows the trend the known analytic results predict. However, our numerical solution systematically overestimates the value of the shift. This is explained because the accuracy in the numerical estimation of the decay rate of a solution towards the stationary state value is a function of the control parameter a. We believe the mismatch between the numerical solution and the analytic results is due to a lack of convergence of our scheme, rather than to lack of accuracy. As our numerical scheme is an hybrid, the convergence problem can be improved, both at the deterministic and at the stochastic parts of the scheme. In this work we left our numerical results on the nonlinear case out, because before proceeding to the investigation of the nonlinear equation, the convergence must be assured in the linear case.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,015
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,003
Tête enseignante GPT0,162
Écart entre enseignants0,160 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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