Novel approaches for the Genetic Improvement of Fertility and Reproduction in Dairy Cattle
Notice bibliographique
Résumé
For decades, animal breeding programs have allowed the dairy industry to select highly productive cows, however, at the same time, reproductive performance has declined. The challenge of selecting fertility-related traits is their low heritability and selection accuracy. Traits that are closer to the biology of the animal, combined with a better understanding of the biological mechanisms and genetic architecture of fertility, could enhance the efficiency of genetic selection. \nIn the first study of this thesis, a recently developed indicator of pregnancy rate, called size and position score of the reproductive tract, was investigated as a potential novel trait for genetic selection to improve fertility. For this aim, genetic parameters were estimated to determine the potential of the score as a novel trait and how it genetically correlates with other economically important traits evaluated in Canada. \nMore than just the conception ability of females, the reproductive outcome is also defined by the gametic compatibility of the mating pair. Little is known about pair compatibility in livestock and investigating its genetic background provides insights into its possible application to optimize mate allocation. In the second study of this thesis, transmission ratio distortion (TRD), a deviation from Mendelian inheritance expectations, was used to identify genomic regions associated with gametic incompatibility. Functional analyses of these regions were used to identify potential biological mechanisms involved, which is the first step towards developing applications for improved mate allocations. \nThe TRD regions identified in the second study were observed to overlap with copy number variant (CNV) regions associated with stillbirth. These CNV are structural variants that can influence gene expression and structure, impacting phenotypic variance. As a result, CNV could be the origin of TRD signals. Considering causes of stillbirth are still largely unknown, functional analyses of these overlapping regions were carried out in the third study to provide insights into the mechanisms, which may be underlying stillbirth in dairy cows. Results pinpointed calving difficulty and, more interestingly, an abnormal uterine inflammation process as potential causes of stillbirth.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».