Occurrence and characterization of resistance to extended-spectrum cephalosporins mediated by β-lactamase CMY-2 in Salmonella isolated from food-producing animals in Canada
Notice bibliographique
Résumé
Resistance of Salmonella to extended-spectrum cephalosporins (ESCs) is being reported with increasing frequency. In humans, infections with Salmonella resistant to ESCs threaten the efficacy of ceftriaxone, the drug of choice for treating salmonellosis in children. To determine the occurrence of resistance to ESCs, we examined 8426 strains isolated from food-producing animals in Canada in 1994–99 for reduced susceptibility or resistance to ceftriaxone. Of the 8 such strains identified (7 from turkeys and 1 from cattle), 5 had reduced susceptibility, and 3 were resistant; 2 were isolated in 1995, 1 was isolated in each of 1996 and 1997, and 4 were isolated in 1999. Isoelectric focusing showed that all 8 isolates produced a β-lactamase with a pI ≥ 9. The strains were resistant to cefoxitin and not inhibited by clavulanic acid. Primers specific for the Citrobacter freundii blaAmpC gene produced the expected product in the polymerase chain reaction. DNA sequencing showed that all isolates possessed the blaCMY-2 gene. Plasmid DNA from all 8 isolates transformed Escherichia coli DH10B, whereas only 1 isolate transferred blaCMY-2 conjugally. All transformants and the transconjugant were resistant to ampicillin, cefoxitin, ceftiofur, cephalothin, streptomycin, sulfisoxazole, and tetracycline. Southern blots of plasmids from the isolates, the transformants, and the transconjugant showed that blaCMY-2 was located on similar-sized plasmids (60 or 90 MDa) in the transformants and the transconjugant. In the S. Typhimurium DT104 and S. Ohio isolates, the floSt gene was found on the same plasmid. Class 1 integrons with the aadB gene cassette were detected in the S. Bredeney isolates but not in their transformants or the transconjugant. Pulsed-field gel electrophoresis and plasmid profiles indicated that both clonal dispersion and horizontal transfer of blaCMY-2 may have caused dissemination of the resistance determinant.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,003 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».