Population identity of North Atlantic humpback whales:An ocean-wide analysis of genetic population structure
Notice bibliographique
Résumé
North Atlantic (NA) humpback whales (Megaptera novaeangliae) undertake seasonal migrations between high latitude feeding areas (ranging from the US coast to the Barents Sea) and low latitude winter breeding grounds in the Caribbean and the eastern NA (e.g., the Cabo Verde Archipelago). We assessed the genetic structure in the NA analyzing genetic data from ~3,000 humpback whales sampled in 14 different locations across the NA as well as off Gabon, a South Atlantic breeding ground. Each individual was sexed, genotyped at 19 microsatellite loci and the mitochondrial control region (mtCR) was sequenced. Bayesian cluster analyses and fixation indices detected two breeding populations within the NA and an additional population off Gabon. A high degree of genetic divergence was detected among the mtCR sequences between the western and eastern NA high latitude summer feeding areas indicative of long-term maternal site-fidelity to these two regions. Kinship-based analyses revealed the high latitude feeding areas in the NA as the summer destination for individuals wintering in the Cabo Verde Archipelago. There were clear signs of gene flow and introgression into the eastern NA breeding population from the Caribbean breeding population; evident by immigrants from the Caribbean breeding population and admixed individuals. The individuals on the eastern NA breeding grounds with a 100% eastern NA ancestry, all shared the same, unique mtCR haplotype; i.e., all belonging to the same single matrilineal lineage. This maternal lineage is endemic to the eastern NA, highlighting the rarity, and thus endangered, of the eastern NA breeding population. Furthermore, the study uncovered evidence of migration from the Southern to the Northern Hemisphere. Overall, our results provide a comprehensive overview of the population structure of NA humpback whales throughout the ocean basin.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».