MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W7033726577

REDUCE, REUSE, RECYCLE: EVALUATING THE CONTRIBUTION OF EUTREMA SALSUGINEUM BYPASSES FOR GLYCOLYTIC SUBSTRATE LEVEL PHOSPHORYLATION IN RESPONSE TO LOW PHOSPHATE CONDITIONS

2024· other· en· W7033726577 sur OpenAlexaffabout

Notice bibliographique

RevueMacSphere (McMaster University) · 2024
Typeother
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueBat Biology and Ecology Studies
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEcotypeGlyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenaseNutrientDehydrogenaseGlycolysisPhosphateEnzyme assayExtremophileSubstrate (aquarium)Starch
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Drought reduces the availability of dissolved nutrients for plant uptake. For the essential macronutrient phosphate (Pi), drought exacerbates its already low soil availability for plant uptake. Understanding the mechanisms allowing plants to thrive under semi-arid, low-Pi conditions enables us to develop climate change resilient crops less reliant on added Pi fertilizers. Eutrema salsugineum is an extremophile plant and the Yukon ecotype thrives on low-Pi soil. Yukon plants can bypass glycolytic glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase (GAPDH) using NADH and Pi to phosphorylate ADP by employing a non-phosphorylating (NP) GAPDH. By avoiding phosphorylation, NP-GAPDH can preserve Pi for alternative use in a deficient plant. The Shandong ecotype is less tolerant of low Pi, so their capacity to use the bypass was also evaluated. GAPDH and NP-GAPDH activity was measured in leaf and root cell-free extracts of plants grown with (+Pi) or without Pi (-Pi). For both ecotypes, up to 10-fold higher activity rates were found in leaf extracts relative to root extracts. In -Pi plants, leaf GAPDH activity was approximately three-fold and two-fold greater relative to +Pi plants for Yukon and Shandong respectively. Leaf NP-GAPDH activity was slightly greater in +Pi relative to -Pi in Yukon plants, while rates were comparable for -Pi and +Pi Shandong plants. Furthermore, NP-GAPDH activity in Yukon and Shandong plants were similar, suggesting that the bypass does not play an essential role for tolerance to low-Pi conditions and raises a question about the true metabolic role of this enzyme in plants.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Autre · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,044
Tête enseignante GPT0,270
Écart entre enseignants0,225 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreAutre

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueMacSphere (McMaster University)→Même sujetBat Biology and Ecology Studies→Travaux en français237 207→