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Enregistrement W7033813790

Solution NMR structure of an immunodominant epitope of myelin basic protein

2006· article· en· W7033813790 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueMax Planck Digital Library · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueNutrition, Health, and Society Studies
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEpitopeHelix (gastropod)Aqueous solutionMyelin basic proteinLinear epitopeProtein structureMyelinNuclear magnetic resonance spectroscopy
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Using solution NMR spectroscopy, three-dimensional structures have been obtained for an 18-residue synthetic polypeptide fragment of 18.5 kDa myelin basic protein (MBP, human residues Q81–T98) under three conditions emulating the protein's natural environment in the myelin membrane to varying degrees: (a) an aqueous solution (100 mm KCl pH 6.5), (b) a mixture of trifluoroethanol (TFE-d<sub>2</sub>) and water (30 : 70% v/v), and (c) a dispersion of 100 mm dodecylphosphocholine (DPC-d<sub>38</sub>, 1 : 100 protein/lipid molar ratio) micelles. This polypeptide sequence is highly conserved in MBP from mammals, amphibians, and birds, and comprises a major immunodominant epitope (human residues N83–T92) in the autoimmune disease multiple sclerosis. In the polypeptide fragment, this epitope forms a stable, amphipathic, α helix under organic and membrane-mimetic conditions, but has only a partially helical conformation in aqueous solution. These results are consistent with recent molecular dynamics simulations that showed this segment to have a propensity to form a transient α helix in aqueous solution, and with electron paramagnetic resonance (EPR) experiments that suggested a α-helical structure when bound to a membrane [I. R. Bates, J. B. Feix, J. M. Boggs & G. Harauz (2004) J Biol Chem, 279, 5757–5764]. The high sensitivity of the epitope structure to its environment is characteristic of intrinsically unstructured proteins, like MBP, and reflects its association with diverse ligands such as lipids and other proteins.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,783
Score d'incertitude au seuil0,188

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,172
Écart entre enseignants0,165 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle