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Enregistrement W7036031932

Analysis of notch-driven regulation of dendritic cell function

2015· dissertation· en· W7036031932 sur OpenAlexfundno aff

Notice bibliographique

RevueeScholarship@McGill (McGill) · 2015
Typedissertation
Langueen
DomaineDecision Sciences
ThématiqueScientific Computing and Data Management
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésNotch signaling pathwayImmune systemInnate immune systemSignal transductionDendritic cellReceptorEffectorLigand (biochemistry)Hes3 signaling axis
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

An effective immune response against pathogens or cancer requires proper guidance of the immune system. Being the first responders in innate immunity, Dendritic Cells (DCs) provide essential and differentiation cues to T cells, guiding them down specific effector lineages. Cell-cell communication through Notch signaling is initiated by trans-binding of receptor and ligand on neighboring cells to guide various cell fate decisions. However, recently it has been shown that cis-interaction of Notch receptor and Delta ligand in mammalian cells can result in inhibition of Notch signaling. DCs are known to express both Notch ligands and receptors. We have previously shown that DCs differentially express Notch ligands in response to stimuli associated with specific TH lineages. These findings suggest that relative abundance of Notch ligands to receptors may lead the cell to adopt a phenotype associated with signaling through either Notch ligand or receptor. Thereby, we hypothesize that the Notch signaling directly regulates DC function and therefore indirectly modulates T-cell polarization. To observe Notch signaling associated with different states of DC activation, we measured expression of components of Notch signal transduction in response to the Toll-like receptor (TLR) ligand lipopolysaccharide (LPS) and Leishmania parasites. Activation of DCs with TH1-directing LPS maintains the low Notch1 levels, but increases Notch2 expression. DCs infected with Leishmania remain immature, even if exposed to LPS subsequently, show higher Notch1 levels. Analysis of Notch1-deficient DCs, illustrated that Notch1 expression negatively regulates DC activation. Similarly, DCs stimulated with TH1-inducing agents maintain low Notch1 levels but have increased Delta4 expression. On the other hand, Notch2 expression positively regulates DC activation. Induced Notch2 expression leads to increased expression of co-stimulatory molecule CD86 and proinflammatory cytokine Interleukin 12 (IL-12). The increased Notch2 expression in DCs stimulated with LPS is, however, accompanied by a reduction in Jagged2 expression. Accordingly, Jagged2 is shown to negatively regulate IL-12 secretion. Such pattern of expression among Notch ligands and receptors (i.e. mutually exclusive expression of Notch1/Delta4 or Notch2/Jagged2) supports the evidence for cis-inhibition, a mechanism by which Notch receptors and ligands expressed on the same cell reciprocally inhibit one another. Such cis-interaction results in removal of the receptors and ligands from the cell surface and their subsequent proteolysis. All in all, our results propose that relative levels of Notch receptor and ligands can directly alter DC phenotype.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,066
Tête enseignante GPT0,326
Écart entre enseignants0,260 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2015
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