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Enregistrement W7036214266

Asymmetric matching allele models: imperfect matching, stability and the impact of mutation

2018· dissertation· en· W7036214266 sur OpenAlexaff

Notice bibliographique

RevueQSpace (Queen's University Library) · 2018
Typedissertation
Langueen
DomaineSocial Sciences
ThématiqueAsian Culture and Media Studies
Établissements canadiensQueen's University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPopulationMatching (statistics)GenotypeEctothermStability (learning theory)Selection (genetic algorithm)
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Asymmetric matching alleles models assume that each parasite genotype specializes on a matching host genotype to a different degree. We study system behavior of a single locus di-allelic asymmetric matching alleles model. Inline with other investigators, we make the counter-intuitive observation that intermediate levels of asymmetric matching lead the parasite genotype with the lowest fitness in it's matching host genotype to, on average, be at majority frequencies. The parasite genotype with the highest fitness in its matching host keeps the frequency of this matching host low, which keeps its own frequency low. Further analysis of our asymmetric matching alleles model yields three novel predictions. To begin, a facet of asymmetric matching whose study has been avoided involves the fitness implications of imperfect matching. Imperfect matching permits reduced fitness for parasites enacting a cross infection. Under imperfect matching, increasing the relative fitness for cross infections lowers the level of asymmetric matching required for a parasite genotype to have the highest fitness when infecting any host, which would drive this parasite genotype to or near fixation. Having this high fitness parasite genotype near fixation yields a selection pressure within the host population to mitigate parasite success by having a high frequency of the cross infection host genotype. The second model prediction demonstrates that asymmetric matching can lead to increased system stability by dampening oscillations and lowering the amount of mutation needed for stability. Finally, our analysis predicts that the magnitude of antagonism between parasites and hosts has a large effect on the genetic composition and system behavior of the host-parasite system. We find that parasite and host mutation contribute differently to these antagonism-mediated effects. Overall, studying the single locus system behavior of asymmetric matching allele models should allow for better informed future studies concerning the effects that asymmetric matching has on; polymorphism incidence, recombination rate and mutation rate evolution.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,009
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Théorique ou conceptuel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,009
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0010,002
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,244
Écart entre enseignants0,234 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeThéorique ou conceptuel
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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