Cauliform bacteria lacking phospholipids from an abyssal hydrothermal vent: proposal of <i>Glycocaulis abyssi</i> gen. nov., sp nov., belonging to the family <i>Hyphomonadaceae</i>
Notice bibliographique
Résumé
Cauliform bacteria are prosthecate bacteria often specialized for oligotrophic environments. A polyphasic approach, comprising 16S rRNA gene sequencing, lipid analysis and salt tolerance characterizations, was used to clarify the taxonomy of one isolate, strain MCS 33<sup>T</sup>, obtained from above the hot water plume of a deep-sea hydrothermal vent near Vancouver island, Canada. Cells contained no detectable phospholipids or sulpholipids, but did contain 1,2-di-O-acyl-3-O-a-d-glucopyranosylglycerol, 1,2-di-O-acyl-3-O-a-d-glucopyranuronosylglycerol and the novel lipid 1,2-di-O-acyl-3-[O-a-d-glucopyranuronosyl]glycerol-6'-<i>N</i>-glycine. It is assumed that the various glucoronosyl lipids are replacing, at least partially, the phospholipids in their various tasks in the cell cycle. The G<i>+</i>C content of the genomic DNA of strain MCS 33<sup>T</sup> was 62.8 mol%, and Q10 was the predominant respiratory ubiquinone. The 16S rRNA gene sequence of this chemoheterotrophic, aerobic, moderately halophilic strain showed only a low similarity of 94.4?% to that of <i>Oceanicaulis alexandrii</i> C116-18<sup>T</sup>, and both strains also differed based on their lipids. Although the novel strain was isolated from seawater sampled near a hydrothermal vent, its optimum temperature for growth was 30 °C. The main cellular fatty acids were C<sub>18?:?1</sub>?7<i>c</i>, C<sub>18?:?0</sub> and the unknown fatty acid ECL 11.798, and the main hydroxy fatty acid was C<sub>12?:?0</sub> 3-OH. The strain is proposed to represent a novel species of a new genus, <i>Glycocaulis abyssi</i> gen. nov., sp. nov. The type strain of the type species is MCS 33<sup>T</sup> (?=?LMG 27140<sup>T</sup>?=?CCUG 62981<sup>T</sup>).
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».