Enabling the P450 complement of Beauveria bassiana and Rhodococcus jostii for biocatalysis \n
Notice bibliographique
Résumé
Enzyme discovery today is proceeding at an enormous pace due to ever-growing technology development. As a result of this, more than 21000 cytochrome P450s have been identified in all kingdoms of life to date, making a wide range of enzyme resources with outstanding potential for biocatalytical implementation available. P450s from filamentous fungi, such as Beauveria bassiana, represent particularly compelling targets for the discovery of novel enzymes as these organisms have a long history of application in industrial hydroxylation reactions, many of which are believed to be P450-dependent. In addition, the genome sequence of B. bassiana has recently been completed revealing 83 putative P450s. \n \nIn order to uncover new cytochrome P450-based biocatalysts from the fungus Beauveria bassiana extensive bioinformatics analysis of the Beauveria CYPome were performed. As a result 7 genes encoding for heme domains with possible alkane hydroxylase function and one encoding a naturally fused P450 with homology to P450foxy from Fusarium oxysporum could be identified for subsequent cloning, heterologous expression and characterization. Different expression hosts as well as various expression conditions have been investigated. Despite our efforts, delivery of active biocatalysts could not be realized. However, empirical data acquired in this project will be of value for future studies of fungal P450s. \n \nIn addition, 23 cytochrome P450 heme domains from Rhodococcus jostii fused to the P450 reductase domain (RhfRED) of cytochrome P450Rhf from Rhodococcus sp. NCIMB 9784 have been investigated in a further strand of this work and provided a screening platform that could be applied for industrial purposes. \n
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».