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Enregistrement W7037411523

Enabling the P450 complement of Beauveria bassiana and Rhodococcus jostii for biocatalysis
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2015· dissertation· en· W7037411523 sur OpenAlexaff

Notice bibliographique

RevueWhite Rose eTheses Online (University of Leeds, The University of Sheffield, University of York) · 2015
Typedissertation
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueSesquiterpenes and Asteraceae Studies
Établissements canadiensYork University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBeauveria bassianaRhodococcusCytochrome P450Heterologous expressionGeneCytochrome P450 reductaseEnzymeRhodococcus equi
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Enzyme discovery today is proceeding at an enormous pace due to ever-growing technology development. As a result of this, more than 21000 cytochrome P450s have been identified in all kingdoms of life to date, making a wide range of enzyme resources with outstanding potential for biocatalytical implementation available. P450s from filamentous fungi, such as Beauveria bassiana, represent particularly compelling targets for the discovery of novel enzymes as these organisms have a long history of application in industrial hydroxylation reactions, many of which are believed to be P450-dependent. In addition, the genome sequence of B. bassiana has recently been completed revealing 83 putative P450s.
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\nIn order to uncover new cytochrome P450-based biocatalysts from the fungus Beauveria bassiana extensive bioinformatics analysis of the Beauveria CYPome were performed. As a result 7 genes encoding for heme domains with possible alkane hydroxylase function and one encoding a naturally fused P450 with homology to P450foxy from Fusarium oxysporum could be identified for subsequent cloning, heterologous expression and characterization. Different expression hosts as well as various expression conditions have been investigated. Despite our efforts, delivery of active biocatalysts could not be realized. However, empirical data acquired in this project will be of value for future studies of fungal P450s.
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\nIn addition, 23 cytochrome P450 heme domains from Rhodococcus jostii fused to the P450 reductase domain (RhfRED) of cytochrome P450Rhf from Rhodococcus sp. NCIMB 9784 have been investigated in a further strand of this work and provided a screening platform that could be applied for industrial purposes.
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Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Qualitatif · Signal consensuel: Qualitatif
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,515
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,246
Écart entre enseignants0,223 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeQualitatif
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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