Effects of the invasive plant spotted knapweed (Centaurea stoebe L.) on grassland arthropod communities: Use of genomic barcoding tools for ecosystems reclamation management
Notice bibliographique
Résumé
British Columbia’s (BC) grasslands are home to 30 percent of the province’s species at risk and are one of Canada’s most endangered ecosystems. In BC’s Southern interior, human activities such as mining, recreation, and in certain instances, heavy livestock grazing, are altering grassland ecosystems; the increased soil disturbance may leave them susceptible to the colonization of invasive species. Invasive species can cause changes to native plant communities and nutrient cycling, and by doing so, may alter the amount and quality of habitat available for animals such as arthropods. Arthropods are diverse and contribute to energy flow and nutrient cycling, and are therefore an important group to study as a way of determining the effects of changes to ecosystem function. Spotted knapweed (Centaurea stoebe L.), a perennial forb native to Eastern Europe, is considered one of the most ecologically harmful invasive species in Western North America. The objectives of this study were (1) to determine if spotted knapweed is altering arthropod community structure and density in grassland habitats; and (2) to DNA metabarcode all arthropod specimens collected using methodology that could be implemented to expedite site restoration efforts. To address these objectives, pitfall traps were installed at sites that were colonized, in differing densities, by spotted knapweed, and DNA metabarcoding was conducted on specimens collected. The results suggest that spotted knapweed density indirectly correlates with arthropod functional groups through changes in plant community composition. These indirect effects show different correlations between the functional groups; suggesting that both top down and bottom up control is at play upon the introduction of spotted knapweed. Decreases in herbivore and detritivore biomass was associated with increasing spotted knapweed density. Omnivore, predator, and parasite biomass had more intricate interactions. DNA metabarcoding results indicated a more complex interaction between Orthoptera and spotted knapweed density than suggested by a simple positive correlation. All other arthropod orders sampled were not obviously influenced by spotted knapweed. This study describes a relatively rapid and inexpensive technique for monitoring arthropod biodiversity with a DNA metabarcoding methodology applicable to both invasive species conservation efforts and for guiding remediation work in disturbed grassland sites.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».