Effects of silver diamine fluoride on oral bacteriome and mycobiome
Notice bibliographique
Résumé
Introduction: Silver diamine fluoride (SDF) is a simple and non-invasive agent to arrest caries in children. The purpose of this study is to investigate changes to the oral bacteriome and mycobiome in young children treated with SDF Methods: Plaque samples were collected from 45 children with early childhood caries (ECC). Frequency regimens of SDF were two applications 4 months apart (4M), two applications 6 months apart (6M), and two applications 1 month apart (1M). DNA was extracted and sent to Genome Quebec Innovation Center for library preparation and paired-end Illumina MiSeq PE300 sequencing of the V4 region of bacterial 16S rRNA and fungal ITS1 rRNA genes. Sequencing data was analyzed using QIIME2 2018.11. Results: A total of 195 carious lesions in 44 children were treated at baseline and followed over two subsequent study visits. The overall arrest rates were 77.69% at Visit 2 and 93.61% at Visit 3 respectively. Arrest rates were higher for all lesions after two applications of SDF. The alpha diversity and beta diversity analysis showed no significant differences in the supragingival bacteriome and mycobiome for all three regimens. Taxonomic assignment showed that Streptococcus, Corynebacterium and Actinomyces were the most abundant genera for Bacteria and Candida, Blumeria, and Malassezia were the most abundant genera for Fungi. Streptococcus mutans and Veillonella dispar both showed a decrease in relative abundance, but these changes were a trend and not found to be statistically significant. Candida albicans was highly abundant in all groups regardless of number of visits or regimens. The differential abundance analysis showed significant changes in both bacterial and fungal species, particularly Lactobacillus spp., Bifidobacterium spp. and Candida spp. Our study found a vast diversity of fungal species and differential abundance analysis suggested that SDF treatment may have an effect on the abundance of specific fungi. Conclusion: SDF was an effective modality for arresting dental caries with higher arrest rates for all lesions after two applications of SDF. Further studies with a larger sample size are needed to confirm whether the presence or absence of various bacterial and fungal species are the result of SDF application at various frequencies.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».