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Enregistrement W7037531280

Étude de l’importance de la lipoxygénase dans la résistance à la gale commune de la pomme de terre

2022· other· fr· W7037531280 sur OpenAlexaboutno aff

Notice bibliographique

RevueKnowledge UdeS (Institutional Deposit of the University of Sherbrooke) · 2022
Typeother
Languefr
DomaineSocial Sciences
ThématiqueGerman Social Sciences and History
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCultivarEnvironmental factorTropical fruit
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

La gale commune est une maladie qui affecte sévèrement la culture de pomme de terre partout dans le monde. Au Canada, la maladie a causé de grandes pertes estimées à environ 17,3 millions de dollars canadiens. L’actinobactérie du sol, Streptomyces scabiei, est un des agents pathogènes responsables de cette maladie qui est principalement caractérisée par le développement de lésions liégeuses sur la surface des tubercules, tout cela conduisant à une diminution de la commercialisation des tubercules atteints. Pour générer ces lésions dans la plante, la bactérie synthétise une phytotoxine appelée thaxtomine A, qui est le facteur pathogénique essentiel pour le développement de la maladie. Dans la recherche de méthodes efficaces et respectueuses de l’environnement pour lutter contre la maladie, l’utilisation et le développement de cultivars de pommes de terre résistantes à la maladie sont en train de devenir les stratégies les plus efficaces et économiquement rentables. Bien qu’il existe certains cultivars de pommes de terre plus résistants à S. scabiei, un grand nombre d’entre eux ne correspondent pas aux exigences des producteurs ou consommateurs. C’est pourquoi, notre laboratoire a mis au point une nouvelle technique pour augmenter la résistance à la gale commune chez divers cultivars de pomme de terre du Québec en utilisant l’habituation des cellules somatiques à la thaxtomine A. En utilisant cette méthode, nous avons obtenu des somaclones issus du cultivar Russet Burbank (RB). Ce cultivar a une résistance modérée à la gale commune de la pomme de terre. Des tests réalisés ont montré que les tubercules du somaclone appelé RB9, sont significativement plus résistants à la gale commune et à la thaxtomine A par rapport à RB. 
\nPour étudier comment la résistance à la gale commune est induite par l’habituation à la thaxtomine A, une analyse protéomique dans les tubercules de RB9 a été réalisée pour les comparer à ceux du cultivar d’origine RB. Cette analyse a démontré que plusieurs protéines liées au stress étaient plus abondantes chez le somaclone RB9 habitué à la thaxtomine A par rapport au cultivar d’origine. Une augmentation jusqu’à deux fois des protéines impliquées dans la réponse de défense de la plante, telles que des patatines, inhibiteurs de protéase et lipoxygénases (LOX) a été mise en évidence. Les LOX ont beaucoup d’importance puisqu’elles peuvent jouer un rôle important dans la gestion des interactions plante - agent pathogène, en activant des mécanismes de réponse et de défense tels que la génération de dommages à la membrane, la production de molécules signal (jasmonates) et la synthèse de substances avec une activité antimicrobienne.
\nNotre étude nous a permis d'évaluer l'importance de LOX dans la résistance à la gale commune de la pomme de terre. En utilisant l'approche de production rapide de minitubercules de RB et du somaclone RB9 à partir de bourgeons foliaires, l'effet de l'inhibition de LOX par des composés pharmacologiques sur l'augmentation de l'indice de sévérité de la gale commune a été mis en évidence. De même, nous avons évalué les niveaux physiologiques de la protéine LOX, son activité et son expression dans les minitubercules de RB et du somaclone RB9 lors d'infection par S. scabiei et le traitement avec des inhibiteurs de LOX et nous avons identifié que la suppression de l'activité LOX augmente la sensibilité à la gale commune. Ainsi, nous avons observé une plus grande abondance et activité LOX dans RB9 en réponse à une infection par S. scabiei. Pareillement, l'activité LOX constitutive dans RB9 a été plus élevée que dans RB, ce qui peut contribuer à une résistance accrue à la maladie dans le somaclone.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Études des sciences et des technologies, Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesÉtudes des sciences et des technologies
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,789
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0020,009
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,224
Écart entre enseignants0,216 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
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