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Enregistrement W7037793448

Exploiting the SCF complex to identify novel therapeutic targets in high-grade serous ovarian cancer

2023· dissertation· en· W7037793448 sur OpenAlexaff

Notice bibliographique

RevueMspace (University of Manitoba) · 2023
Typedissertation
Langueen
DomaineEarth and Planetary Sciences
ThématiqueSubterranean biodiversity and taxonomy
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSynthetic lethalityPARP1Ovarian cancerIn silicoDiseasePhenotypeSerous fluidOlaparib
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

An overarching, yet elusive goal for cancer researchers is to develop novel therapeutic strategies by identifying drug targets that will improve the lives and outcomes of cancer patients. High-grade serous ovarian cancer (HGSOC) remains the most lethal gynecological malignancy, with an estimated ~3,100 Canadians diagnosed and ~1950 succumbing to their disease each year. Unfortunately, >70% of HGSOC patients are diagnosed at stages III or IV and will eventually succumb with drug resistant disease. Therefore, new, more effective drug targets are urgently needed to address the poor morbidity and mortality associated with HGSOC. Recent genetic studies have determined that reduced expression of SKP1, CUL1 or RBX1 induces chromosome instability (CIN), or ongoing changes in chromosome complements, that is suspected to contribute to HGSOC pathogenesis. As copy-number losses of these genes occur in ~87% HGSOCs, the current study seeks to exploit these alterations using a synthetic lethal (SL) paradigm. Synthetic lethality is an innovative therapeutic strategy and is defined as the rare/lethal combination of two independently viable mutations/deletions. Accordingly, identifying SL interactors of the SCF complex (i.e., novel drug targets) would allow us to selectively exploit the aberrant genetics suspected to contribute to HGSOC pathogenesis. To identify 228 putative SL interactors of SKP1, CUL1 and RBX1, in silico and siRNA-based approaches were employed within FT secretory epithelial cellular contexts. Of these, CDK2 and PARP1 were prioritized for validation within RBX1+/- clones. To validate SL interactors, siRNAs and small-molecule inhibitors targeting PARP1 or CDK2 were combined with single-cell quantitative imaging microscopy (QuantIM) to assess SL phenotypes within RBX1+/- and NT-Control clones. QuantIM results reveal decreases in the number of RBX1+/- clones following silencing or inhibition of PARP1 or CDK2 relative to NT-Control clones, that corresponds with increases in γ-H2AX abundance, a marker of DNA DSBs. Collectively, the work presented in this thesis supports that PARP1 is a novel SL interactor of RBX1 and that CDK2 is an evolutionarily conserved SL interactor of the SCF complex. Furthermore, these findings highlight the potential clinical utility of utilizing Olaparib and/or SNS-032 for the treatment of HGSOCs exhibiting diminished expression of RBX1.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,089
Tête enseignante GPT0,244
Écart entre enseignants0,154 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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