GFP-based screen for meiotic mutants in «C. elegans»
Notice bibliographique
Résumé
Meiosis causes the reduction of diploid cells into haploid gametes playing a significant role in all sexually reproducing organisms. The progression of meiosis can be broken down into two stages: meiosis-I and meiosis-II. In meiosis-I, homologous chromosomal segregation results in the formation of a chiasma – a secure connection between homologs. Establishing a chiasma requires three major landmarks between homologous chromosomes: recognition and alignment, synapsis, and recombination. A defect in any one of these key events can cause chromosomal non-disjunction or cell aneuploidy. The nematode Caenorhabditis elegans has many attributes that make it a well-suited model for studying various aspects of meiosis. The germ-line nuclei mature in a spatiotemporal manner, and the nuclei are easily distinguishable, during their progression of meiotic prophase-I, through DAPI staining. Should a mutation impair homologous chromosomal segregation of the X-chromosome the progeny of the animal will bear a visibly higher percentage of males, presenting a 'High Incidence of Males', or a 'Him', phenotype. The goal of this study is to screen, identify, and isolate more Him mutations by building on the screen "Green Eggs and Him". Nineteen Him mutants have been isolated, and 17 studied, in this project. DAPI staining has allowed the categorization of the mutants into: cell cycle, pairing, synapsis, or recombination defective mutants. Measuring autosomal and X-chromosome non-disjunction levels have allowed for an additional severity-level categorization for each of the seventeen mutations found. 4 mutations were found to be severe, 3 as severe/moderate, 2 moderate, 4 as moderate/low, and 4 were categorized as low-severity mutations. 9 of the 17 mutations were determined as having recombination deficiencies; 5 as pairing/synapsis defects – where the deficiency could be in just one of the processes, or compounded in both;
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».