Functional and genetic dissection of susceptibility to experimental «Cryptococcus neoformans» infection
Notice bibliographique
Résumé
This thesis examines the functional and genetic factors that control the inbred mouse host response to Cryptococcus neoformans. The inbred mouse strains C57BL/6J and C3H/HeN were susceptible, and the inbred mouse strains CBA/J and SJL/J were resistant, to experimental cryptococcal pneumonia. This observation led to three general hypotheses: (1) early innate immune differences between inbred strains cause differential susceptibility to cryptococcal pneumonia; (2) natural variation in susceptibility among inbred strains is a complex trait under the control of specific genetic loci; and (3) allergic airway disease is a common phenotype among susceptible inbred strains. Functional characterization of the innate immune response in C57BL/6J and SJL/J mice revealed a heightened pro-inflammatory response in SJL/J as early as three hours post-infection. This polarization continued throughout the course of infection; C57BL/6J mice presented an allergic, Th2 immune response, and SJL/J mice presented a Th1 immune response. Intracellular signaling analysis in vitro revealed that the enhanced pro-inflammatory response observed in SJL/J mice was dependent on the prolonged activation of the NF-κB and phosphatidylinositol 3 kinase pathways. Next, a quantitative trait loci (QTL) analysis for cryptococcal pneumonia susceptibility in a segregating F2 population bred from the parental inbred strains C57BL/6J and CBA/J was performed. This revealed a sex-effect in the quantitative lung fungal burden that warranted a stratified QTL analysis approach. Two significant novel QTL were identified in the female F2 intercross: Cnes1 on chromosome 1, and Cnes2 on chromosome 17. Cnes3 was identified in the male F2 intercross as a unique QTL distal to Cnes2. Furthermore, a genome-wide pairwise analysis revealed significant QTL interactions in both the female and male F2 intercrosses that collectively explained 43.8 and 19.5% of the phenotypic variance in each sex, respectively. Finally, characte
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».