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Enregistrement W7038444830

The implication of GPP130 shedding by PC7 and Furin in lung cancer progression

2023· dissertation· fr· W7038444830 sur OpenAlexaboutno aff

Notice bibliographique

RevuePapyrus : Institutional Repository (Université de Montréal) · 2023
Typedissertation
Languefr
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEndoplasmic Reticulum Stress and Disease
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésFurinLung cancerCancerLung disease
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Le cancer du poumon est la principale cause de mortalité par cancer au Canada et \nentraîne un taux de mortalité important chez les patients. En effet, l’Organisation \nMondiale de la Santé (OMS) indique que le cancer du poumon est la principale cause de \ndécès liés au cancer dans le monde, avec 2.21 millions de diagnostics par année qui \nconduisent en moyenne à 1.8 millions de décès par an. Initialement asymptomatique, ce \ncancer évolue rapidement, devenant très invasif et métastatique, et est alors responsable \nde plus de morts par an que ces quatre cancers meurtriers combinés : côlon, sein, \nprostate et pancréas. \nLes Proprotéines Convertases (PCs) sont une famille de 9 sérines protéases qui jouent \nun rôle dans la maturation des précurseurs de protéines. Les PCs activent/désactivent \nces précurseurs en les clivant à un unique ou une paire de résidus d’acides aminés et \nsont ainsi essentiels pour divers processus biologiques, tels que l’activation de facteurs \nde croissance qui jouent un rôle vital dans la transformation cellulaire et les risques de \nformation de tumeurs. Parmi les neufs membres des sérines protéases identifiées, les \nrôles physiologiques du septième membre de la famille, PC7, restent encore largement \nméconnus à ce jour. Afin d'identifier davantage de substrats de PC7, un criblage \nprotéomique quantitatif a été réalisé pour l'enrichissement sélectif de polypeptides Nglycosylés, \nsécrétés par les cellules hépatiques HuH7. Deux protéines \ntransmembranaires de type II clivées par PC7/Furine, et sécrétées sous forme soluble, \nont alors été identifiées : CAncer Susceptibility Candidate 4 (CASC4) and Golgi \nPhosphoProtein de 130 kDa (GPP130). Des études ultérieures menées sur CASC4 par \niii \nnotre laboratoire ont mis en évidence son rôle protecteur contre la migration et l'invasion \ndu Cancer du Sein Triple Négatif. \nGPP130 est une protéine transmembranaire de type II avec un domaine luminal \ncontenant des déterminants endosomaux et de récupération du Golgi, lui offrant une voie \nde trafic cellulaire unique. Jusqu'à présent, le rôle de GPP130 a principalement été étudié \ndans la liaison et le trafic rétrograde des Shiga-toxines. Un récent rapport a cependant \naussi montré son implication dans la progression du cycle cellulaire et dans la \nprolifération des cellules du cancer de la tête et du cou. Ainsi, notre analyse du cBioPortal \npour Cancer Genomics a révélé que GPP130 est amplifié jusqu'à 35% chez les patients \natteints de cancer du poumon. Le travail présenté ici montre les implications du clivage \nde GPP130 par PC7 et Furine dans la progression du cancer du poumon, en identifiant \nla région de GPP130 responsable de la croissance cellulaire. Ce projet dévoile ainsi des \nstratégies thérapeutiques potentielles ciblant la prolifération cellulaire induite par \nGPP130.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,003
Tête enseignante GPT0,213
Écart entre enseignants0,211 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
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