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Enregistrement W7038643086

The host immune response of MOLF/Ei mice to salmonella typhimurium infection: studying the Ity2 and Ity3 loci

2014· dissertation· en· W7038643086 sur OpenAlexfundno aff

Notice bibliographique

RevueeScholarship@McGill (McGill) · 2014
Typedissertation
Langueen
DomaineEngineering
ThématiqueApplied Advanced Technologies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésCongenicSalmonellaTyphoid feverAlleleImmune systemLocus (genetics)Salmonella infectionSalmonella typhiPhenotype
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Typhoid fever and salmonellosis, which are caused by Salmonella Typhi and typhimurium respectively, are responsible for significant morbidity and mortality in both developed and developing countries. We model typhoid fever using mice infected with Salmonella typhimurium, which results in a systemic disease, whereby the outcome of infection is variable in different inbred strains of mice. Previous work in our laboratory has identified three loci (Ity, Ity2 and Ity3) in the wild-derived MOLF/Ei mice influencing survival after infection with Salmonella typhimurium. The MOLF/EI alleles at Ity and Ity2 are protective, while the MOLF/Ei allele at Ity3 confers susceptibility. We generated a novel cross combination between the highly susceptible strain, MOLF/Ei, and the resistant strain, 129S6, to better define the genetic architecture of susceptibility to infection in MOLF/Ei. We used microarrays and transcriptional profiling to examine the response of uninfected and infected Ity2 congenic mice. These analyses highlighted a role for both type-1-IFN and TRP53 signaling in the pathogenesis of Salmonella infection in the wild-derived MOLF/Ei mice. In order to further study the Ity3 locus, we established a congenic strain (B6.MOLF-Ity/Ity3) with the MOLF/Ei Ity3 donor segment on a C57BL/6J background, and a control B6.MOLF-Ity strain as well as 12 sub-congenic strains. We then studied these sub-congenic mice for survival. This approach indicated that the Ity3 locus is composed of two sub-loci that contribute collectively to the susceptibility of B6.MOLF-Ity/Ity3 congenic mice to Salmonella infection. The Ity3.1 sub-locus controls NADPH oxidase activity and is characterized by decreased ROS production, reduced inflammatory cytokine response and increased bacterial burden, thereby supporting a role for Ncf2 (neutrophil cytosolic factor 2 a subunit of NADPH oxidase) as the gene underlying this sub-locus. The Ity3.2 sub-locus is characterized by a hyper-responsive inflammatory cytokine phenotype after exposure to Salmonella.Lastly we used gene expression profiling to study the important genetic networks controlled by the Ity3 locus. This analysis indicated that the Ity3.1 sub-locus defined a global gene expression signature with networks articulated around Ncf2. Furthermore, based on differential expression and complementation analysis using Selp (Selectin-P) knock-out mice, Selp was identified as a strong candidate gene for the Ity3.2 sub-locus. Overall, this research provides support to the combined action of hormonal influences and complex genetic factors within the Ity2, Ity3 locus in the innate immune response to Salmonella infection in wild-derived MOLF/Ei mice.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Études des sciences et des technologies
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,154
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,224
Écart entre enseignants0,215 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2014
Routes d'admission1
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