Investigating the Interactions of Fatty Acids, Amyloid Beta & SARS-CoV-2 Spike Protein Fragment
Notice bibliographique
Résumé
There is no cure for Alzheimer’s disease (AD), and the negative implications of having AD were further exacerbated in recent years, as patients with dementia are at the highest risk for mortality upon contracting COVID-19. The amyloid cascade theory postulates that AD is caused by toxic aggregates of amyloid beta (Aβ) peptide. The main objective of this project was to design, synthesize and evaluate a library of fatty acid derivatives based on docosahexaenoic acid (DHA), oleic acid (OA), eicosapentaenoic acid (EPA), linoleic acid (LNA), and α-linolenic acid (ALA) as inhibitors of Aβ42 aggregation. 10 fatty acid derivatives were synthesized, characterized, and evaluated for Aβ42 aggregation inhibition activity using thioflavin T-based Aβ42 aggregation kinetics assays. The methyl ester derivatives were found to be the most promising inhibitors, with the LNA derivative methyl (9Z,12Z)-octadeca-9,12-dienoate (2a) being the most potent (61% inhibition at 25 μM). Transmission electron microscopy (TEM) experiments confirmed the anti-aggregation activity of 2a, and computational modeling studies suggest that the evaluated fatty acid derivatives bind in a narrow channel at the interface of the N- and C-termini in the Aβ42 pentamer model. Furthermore, the fatty acid derivatives were not toxic to HT22 mouse hippocampal cells (cell viability ~94–104% at 25 μM). Our secondary objective was to evaluate amyloidogenic peptide fragment FKNIDGYFKI derived from the SARS-CoV-2 spike protein for its ability to promote Aβ42 aggregation. Interestingly, the decapeptide was found to inhibit Aβ42 aggregation at all tested concentrations (~37–52%). In summary, thesis outcomes demonstrate that fatty acid derivatives and spike peptide fragment exhibit anti-Aβ42 activity by direct binding and have the potential to be used as novel pharmacological tools to study Aβ aggregation and to design novel therapies to treat AD.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».