Narrowing the Rab GAP: identifying a role for TBC-2 in endosomal trafficking in «Caenorhabditis elegans»
Notice bibliographique
Résumé
By controlling many steps of organelle biogenesis and cargo transport, Rab GTPases are central regulators of vesicular trafficking in endocytic and exocytic pathways. During endosomal maturation, coordinated activity of the early endosomal Rab5 and late endosomal Rab7 GTPases is required for a proper cargo delivery to the lysosome. It has been proposed that Rab5 induces Rab7 recruitment on vesicles, which in turn, induces Rab5 inactivation and removal. However, this Rab5 and Rab7 coupling model is incomplete without regulatory elements such as Rab GAPs to restrict their spatio-temporal overlap. In the present thesis, we have identified TBC-2, a conserved putative Rab GAP, as a regulator of endosome to lysosome trafficking in C .elegans. Our data show that TBC-2 localizes on late endosomes in a RAB-7 dependent manner. Consistent with the Rab conversion model, TBC-2 functions as a GAP to inactivate RAB-5 to facilitate early to late endosome transition. Furthermore, works from this thesis demonstrate that loss of tbc-2 perturbs the normal degradation of the yolk, a cholesterol binding/transport protein that has been suggested to serve as an energy source during development. Consistent with that, we observed that tbc-2 mutant L1 larvae die prematurely when hatched in absence of food. The exact function of yolk in C. elegans is not fully understood but our data suggest that yolk might be important for survival of starvation-induced L1 diapause in C. elegans. These studies highlight that a tight coordination between Rab GTPases and their regulators is essential for intracellular trafficking and alteration of this process causes detrimental effect on physiological function. They also underline that better understanding of mechanisms of vesicular transport is important for unravelling the etiology of trafficking diseases.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».