MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W7039934492

NRF1-Induced lncRNA DDX11-AS1 Contributes to the Progression of Hepatocellular Carcinoma via Activating CA9 Expression and the MEK/ERK Pathway

2025· article· en· W7039934492 sur OpenAlexaff

Notice bibliographique

RevueDOAJ (DOAJ: Directory of Open Access Journals) · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueColeoptera Taxonomy and Distribution
Établissements canadiensNational Research Council Institute for Biodiagnostics
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHepatocellular carcinomaCenter (category theory)General hospitalRNAExpression (computer science)Messenger RNAmicroRNAClinical treatment
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Yingnan Li,1,2 Mengjiao Shi,1,3 Beibei Bie,4 Hongwei Tian,1,3 Jun Li,1,3 Zongfang Li,1– 3 Jin Sun1,3 1Department of General Surgery, National-Local Joint Engineering Research Center of Biodiagnostics and Biotherapy, The Second Affiliated Hospital of Xi’an Jiaotong University, Xi’an, 710004, People’s Republic of China; 2Center for Tumor and Immunology, The Precision Medical Institute, The Second Affiliated Hospital of Xi’an Jiaotong University, Xi’an, 710115, People’s Republic of China; 3Shaanxi Provincial Clinical Research Center for Hepatic & Splenic Diseases, The Second Affiliated Hospital of Xi’an Jiaotong University, Xi’an, 710004, People’s Republic of China; 4Department of Pharmacy, Medical School, Xi’an Peihua University, Xi’an, 710125, People’s Republic of ChinaCorrespondence: Zongfang Li, Department of General Surgery, National & Local Joint Engineering Research Center of Biodiagnostics and Biotherapy, The Second Affiliated Hospital, Xi’an Jiaotong University, No. 157 West 5th Road, Xi’an, 710004, People’s Republic of China, Email lzf2568@xjtu.edu.cn Jin Sun, Department of General Surgery, National & Local Joint Engineering Research Center of Biodiagnostics and Biotherapy, The Second Affiliated Hospital, Xi’an Jiaotong University, No. 157 West 5th Road, Xi’an, 710004, People’s Republic of China, Email jinsun2014@foxmail.comPurpose: DDX11 antisense RNA 1 (DDX11-AS1) has been recognized for its strong correlation with hepatocellular carcinoma (HCC). Nevertheless, the exact biological functions and fundamental molecular processes of DDX11-AS1 in HCC require further in-depth investigation.Methods: A comprehensive bioinformatics analysis was carried out to explore the expression of DDX11-AS1 and its clinical implication in HCC utilizing the TCGA data. qRT-PCR was employed to validate the expression of DDX11-AS1 in HCC tissues/cell lines. RNA fluorescence in situ hybridization (RNA-FISH) was used to observe the subcellular localization of DDX11-AS1 in HCC cells. Loss-of-function experiments, both in vitro and in vivo, were executed to elucidate the biological functions of DDX11-AS1 in HCC. RNA sequencing (RNA-seq) was employed to identify genes and signaling pathways potentially regulated by DDX11-AS1. Rescue experiments were conducted to validate that carbonic anhydrase IX (CA9) mediates DDX11-AS1 promoting HCC progression. The influence of nuclear respiratory factor 1 (NRF1) on the transcription of DDX11-AS1 was investigated through dual-luciferase reporter assays and ChIP-qPCR.Results: The increased expression of DDX11-AS1 is positively associated with several aggressive clinical characteristics (pathologic T stage, histologic grade, AFP level, and vascular invasion), and is closely linked to unfavorable outcomes in HCC patients, acting as a separate hazardous factor for overall survival. DDX11-AS1 is predominantly situated in the nucleus of HCC cells. DDX11-AS1 knockdown impeded the growth, migration, and invasion capabilities of HCC cells in vitro, and reduced the tumor enlargement in a subcutaneous mouse model. RNA-Seq unveiled that silencing DDX11-AS1 lessened the expression of CA9 and suppressed the activity of the MEK/ERK signaling cascade in HCC cells. Rescue experiments uncovered that CA9 acts as a downstream target facilitating the cancer-causing roles of DDX11-AS1 in HCC. Furthermore, DDX11-AS1 was revealed to be transcriptionally regulated by NRF1.Conclusion: DDX11-AS1, a NRF1-induced lncRNA, facilitates HCC development by upregulating CA9 expression and activating the MEK/ERK signaling cascade.Keywords: hepatocellular carcinoma, DDX11-AS1, CA9, MEK/ERK signaling, NRF1

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,021

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,127
Tête enseignante GPT0,435
Écart entre enseignants0,308 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueDOAJ (DOAJ: Directory of Open Access Journals)Même sujetColeoptera Taxonomy and DistributionTravaux en français237 207