Povezanost polimorfizama gena za serotoninski transportni sustav s fenotipom Crohnove bolesti
Notice bibliographique
Résumé
In this retrospective case-control study we analyzed the potential association of the promoter (5-HTTLPR and rs25531) and intronic Stin2 VNTR polymorphic regions of the SLC6A4 gene with the incidence of Crohn's disease (CD). The study included 192 CD patients and 157 healthy control subjects (age and gender matched with patients group). Genotyping was performed by polymerase chain reaction and correlation of polymorphic SLC6A4 gene variants with CD and its clinical subtypes was analyzed by chi-square and Fisher's exact test, binary logistic regression and haplotype analysis. The results confirmed similar gender (CD: 88 (45.8%) female, 104 (54.2%) male; HC: 84 (53.5%) female, 73 (46.5%) male; χ2 = 2.03, df =1, P = 0.154) and age (CD: 41.34±12.789; HC: 41.68±8.789; P = 0.091) distribution among CD and HC groups involved in the study. Significant difference was observed in STin2 genotype (CD: χ2=15.86, df = 4, P = 0,003; females: χ2 = 15.33, df = 4, P = 0.004) and allele (CD: χ2 = 12.03; df = 2, P = 0.002; females: χ2 = 9.85, df = 2; P = 0.007) distribution between CD and HC and between corresponding female subgroups, with significant negative association (CD: P = 0.013, OR adjusted by age and gender = 0.5, 95% CI=0.29-0.86; females: P = 0.006, OR adjusted by age = 0.32, 95% CI=0.14-0.72) of biallelic ss (STin2.9 and Stin2.10) STin2 genotype with CD, and significantly higher S-STin2.12 ( 5-HTTLPR/rs25531: S-STin2: STin2.12) haplotype distribution (P = 0.004, OR=1.62, 95 % CI=1.16-2.26) in CD. There was no significant association between 5-HTTLPR and rs25531 genotype or allele frequencies and CD or between any SLC6A4 polymorphic loci among different clinical subtypes of Crohns disease classified according to Montreal consensus. In conclusion, STin2 VNTR polymorphism of SLC6A4 gene may contribute to the pathogenesis of CD.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».