Porcine enterotoxigenic Escherichia coli O149: virulence and molecular tools to study its distribution
Notice bibliographique
Résumé
Enterotoxigenic 'Escherichia coli' O149 (ETEC O149) is a dominant serogroup of ETEC causing porcine postweaning diarrhea (PWD) worldwide. The objectives of the study were to (a) assess the virulence of an emerged clone of ETEC O149:H10 in an experimental PWD model (b) develop an effective detection tool to identify pigs infected with ETEC O149 and (c) study the distribution and kinetics of ETEC O149 in sows, piglets, and their environment on two swine farms. A new ETEC O149:H10 clone has been associated with increased intensity and frequency of diarrhea in piglets in Ontario, Canada. This new clone harbours a plasmid pTENT2, carrying the tetracycline resistance gene 'tetA' and the virulence genes 'estA, paa,' and 'sepA' which were not present in earlier ETEC O149 clones from the same region. In the present study, the severity of diarrhea was significantly higher in piglets inoculated with a pTENT2-positive ETEC O149 compared to piglets inoculated with a pTENT2-negative ETEC O149, suggesting an important role played by this plasmid in the increased intensity of diarrhea. The use of tetracycline in feed had no effect on severity of diarrhea and on persistence of ETEC O149 in the intestine when the piglets were inoculated with pTENT2-positive ETEC O149. This suggests a minimal effect of tetracycline in PWD induced by pTENT2-positive ETEC O149. A real-time PCR assay was developed as a diagnostic and epidemiological tool using a sequence specific for 'E. coli' O149 present on its 0 antigen gene cluster. The assay was highly specific and sensitive for the qualitative but not quantitative detection of 'E. coli' O149 in swine fecal samples. This tool was successfully applied to assess the 'E. coli' O149 environmental contamination and carriage by sows, and to study the kinetics of ETEC in piglets during the preweaning period. Both sows and fomites were potential sources of ETEC for the piglets. Differences were observed in the frequency of environmental contamination and sow colonization, and kinetics of ETEC in piglets between a problem and non-problem farm. Further investigations are needed to identify the influence of these factors and of immunity on the occurrence of PWD.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».