Proteomic characterisation of wine yeast\nstrains for the expression of arginases\ninvolved in urea formation during\nfermentation
Notice bibliographique
Résumé
Wine is a fermented beverage widely consumed all over the world as a recreational drink, but is known for its health benefits to humans.However, wine contain urea, a by-product of arginine hydrolysis by arginases expressed during fermentation by the wine yeast Saccharomyces cerevisiae, which reacts spontaneously with ethanol to form ethyl carbamate (EC).Ethyl carbamate was implicated in toxicity and carcinogenicity.Subsequently, small scale (18 L) Sauvignon Blanc and Cabernet Sauvignon winemaking trials using commercial wine yeasts were initialised during the 2014 and 2015 vintages to measure urea in final wines.The overall aim of this study was to investigate wine yeast protein expression during alcoholic fermentation and establish a possible correlation between urea formation by wine yeast and up/down regulated yeast proteins.Ion-exchange chromatography in conjunction with spectrophotometry was used to measure urea levels in bottled wines.The yeast strain, Prise de Mousse (PdM) was shown to be the lowest urea producer in both Sauvignon Blanc and Cabernet Sauvignon wines.The highest urea producing yeast strain i.e.UCD522 produced Cabernet Sauvignon and Sauvignon Blanc wines with urea exceeding 2 mg/L.Therefore, urea levels in these wines are above the Canadian legal limit, but comply with the USA voluntary limit (5 mg/L).Chemical analyses showed that all wines fermented to dryness and the sensory evaluations showed that none of the wines were negatively perceived by the judges.Sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis (SDS-PAGE) showed differential protein expression for the various yeast strains.Proteins of interest were, therefore, excised and characterised using matrixassisted laser desorption ionisation time of flight mass spectrometry (MALDI-TOF/MS).Characterisation of the proteins released from seven Saccharomyces yeasts during alcoholic fermentation were performed, by visualizing the protein profile on SDS-PAGE and identifying the differential expressed proteins in the fermentations with MALDI-TOF.It was observed that the yeast EC1118 that produced Sauvignon Blanc and Cabernet Sauvignon wines with a positive association with volatile acidity (VA), upregulated the protein HSC82 associated with stress response.Therefore, this observation compliments previous research, since VA is known to be produced by wine yeast in response to stressful environments.It is also noteworthy, that the high urea producing reference UCD522 that produced Sauvignon Blanc wines with a negative association with VA also expressed the HSC82 stress response http://etd.uwc.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».