MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W7043108290

The role of the stringent response in the regulation of anti-oxidant defenses in «Pseudomonas aeruginosa»

2013· other· en· W7043108290 sur OpenAlexvenueno aff

Notice bibliographique

RevueLibrary and Archives Canada (Government of Canada) · 2013
Typeother
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial biofilms and quorum sensing
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCatalaseReactive oxygen speciesOxidative stressHydrogen peroxideIntracellularStringent responseMutantBacteriaGuanosine
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The stringent response (SR) is a conserved bacterial stress response mechanism that allows bacteria to survive during stress and starvation. This response is mediated by (p)ppGpp, a hyperphosphorylated guanosine signal that regulates expression of genes to inhibit cellular proliferation and induce genes important for survival and adaptation. This study investigates the role of the SR in regulating oxidative stress pathways in Pseudomonas aeruginosa (PA), a human opportunistic pathogen that can cause infections in immunocompromised patients, and patients suffering from cystic fibrosis. Our results demonstrate that inactivation of the SR significantly increased susceptibility to killing by multiple oxidants, impaired anti-oxidant defenses, and increased the levels of endogenous reactive oxygen species (ROS). In addition, we demonstrated that overexpressing KatA, the primary catalase in PA, protected the ΔSR mutant from hydrogen peroxide killing as well as several antibiotics. Our results also suggested that hydroxyalkyl quinolone molecules were responsible for increased intracellular levels of ROS but did not impair catalase activity. In summary, we found that the SR was required for tolerance against oxidative stress, and regulated expression of both catalases katA and katB. Finally, overexpression of the KatA catalase was sufficient to protect against hydrogen peroxide killing, and partially protected against antimicrobial killing.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,002
Tête enseignante GPT0,142
Écart entre enseignants0,140 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueLibrary and Archives Canada (Government of Canada)→Même sujetBacterial biofilms and quorum sensing→Travaux en français237 207→