MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W7043278505

Salt tolerance of archaeal extremely halophilic lipid membranes: J.Biol.Chem.

2006· article· en· W7043278505 sur OpenAlexvenueno aff

Notice bibliographique

RevueNPARC · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueLipid Membrane Structure and Behavior
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHalophileMembraneVesicleHalobacteriaceaeLamellar phaseArchaeaMembrane lipidsLamellar structureSodium
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The membranes of extremely halophilic archaea are characterized by abundance of a diacidic phospholipid, archaetidylglycerol methylphosphate (PGP-Me), which accounts for 50-80 mol% of the polar lipids, and by the absence of phospholipids with choline, ethanolamine, inositol and serine head groups. These membranes are stable in concentrated 3-5M NaCl solutions, while membranes of non-halophilic archaea, which do not contain PGP-Me, are unstable and leaky in such conditions. By means of X-ray diffraction and vesicle permeability measurements we demonstrate that PGP-Me contributes in an essential way to membrane stability in hypersaline environments. Large unilamellar vesicles (LUV) prepared from the polar lipids of extreme halophiles, H. halobium and H. salinarum, retain entrapped carboxyfluorescein and resist aggregation in the whole range 0-4M NaCl, similarly to LUV prepared from purified PGP-Me. By contrast, LUV made of polar lipid extracts from moderately halophilic and non-halophilic archaea (M. jannaschii, M. mazei, M. smithii) are leaky and aggregate at high salt concentrations. However, adding PGP-Me to M. mazei lipids results in gradual enhancement of the LUV stability, in correlation with the PGP-Me content. The LUV data are substantiated by the X-ray results, which show that H. halobium and M. mazei lipids have dissimilar phase behavior and form different structures at high NaCl concentrations. H. halobium lipids maintain an expanded lamellar structure with spacing of 8.5-9 nm, which is stable up to at least 100 degrees C in 2M NaCl and up to ~60 degrees C in 4M NaCl, while M. mazei lipids form non-lamellar structures, represented by the Pn3m cubic phase and the inverted hexagonal HII phase. From these data, the forces preventing membrane aggregation in halophilic archaea appear to be steric repulsion due to the large head group of PGP-Me or, possibly, out-of-plane bilayer undulations rather than electrostatic repulsion due to the doubly charged PGP-Me head group

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,228
Écart entre enseignants0,219 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueNPARC→Même sujetLipid Membrane Structure and Behavior→Travaux en français237 207→