The Role of Cytoplasmic Poly(A)-Binding Protein in Modulating the Mammalian Transcriptome
Notice bibliographique
Résumé
Gene expression is a tightly regulated process fundamental to cellular function, identity, and adaptation.Among the key regulators of post-transcriptional gene expression, cytoplasmic poly(A)-binding proteins (PABPCs) play a crucial role in controlling mRNA stability, translation efficiency, and decay.This thesis investigates the context-dependent functions of PABPCs in mammalian cells, with a particular focus on their interactions with translation factors, mRNA decay machinery, and stress response pathways.I examine how PABPCs influence translation efficiency under different cellular conditions, challenging the conventional closed-loop model of translation, which posits that PABPC bridges the 5' cap and 3' poly(A) tail to enhance translation initiation.Recent findings indicate that not all mRNAs adopt a closed-loop conformation, suggesting alternative mechanisms for ribosome recruitment.Additionally, this work explores the role of PABPCs in stress granule dynamics, particularly in relation to neurodegenerative diseases.Furthermore, this thesis highlights the interplay between PABPCs and viral infections, where certain viruses manipulate PABPC interactions to hijack host translation machinery.By integrating insights from molecular biology, structural biochemistry, and cellular imaging studies, this research provides a comprehensive overview of PABPC function and its broader implications for gene expression regulation, disease mechanisms, and potential therapeutic interventions.These findings emphasize that PABPC activity is highly adaptable, influenced by cell type, environmental stress, and pathological conditions.Understanding the diverse roles of PABPCs opens new avenues for targeted therapies in cancer, viral infections, and neurodegenerative disorders.Résumé (French) L'expression génique est un processus finement régulé, fondamental pour la fonction, l'identité et l'adaptation cellulaires.Parmi les régulateurs clés de l'expression génique posttranscriptionnelle, les protéines de liaison à la queue poly(A) cytoplasmiques (PABPCs) jouent un rôle essentiel dans le contrôle de la stabilité des ARNm, de l'efficacité de la traduction et de leur dégradation.Cette thèse explore les fonctions contextuelles des PABPCs dans les cellules de mammifères, en mettant l'accent sur leurs interactions avec les facteurs de traduction, les voies de dégradation des ARNm et les réponses au stress cellulaire.J'analyse comment les PABPCs influencent l'efficacité de la traduction selon les conditions cellulaires, en remettant en question le modèle de boucle fermée qui propose que les PABPCs
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».