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Enregistrement W7043453449

SINGLE NUCLEOTIDE POLYMORPHSIM AND METHYLATION ANALYSIS OF HTR1B AND NOTCH4 IN SCHIZOPHRENIA AND AFFECTIVE DISORDER

2008· article· en· W7043453449 sur OpenAlexaboutno aff

Notice bibliographique

RevueScholarship@Western (Western University) · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineMaterials Science
ThématiqueEnzyme Structure and Function
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSingle-nucleotide polymorphismCandidate geneSchizophrenia (object-oriented programming)DNA methylationGeneMethylationNeurodevelopmental disorderGenetic association
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Schizophrenia and affective disorder are common, related mental disorders. They are episodic or chronic in nature and first present between adolescence and adulthood. The symptoms of the two diseases are variable, overlap and include mania, depression, delusions, hallucinations and disorganization of speech and behaviour. Treatments for both diseases include antidepressants and antipsychotics, but there are no cures. Both are thought to be neurodevelopmental in nature and family studies have demonstrated strong genetic components. The search for these genetic components has identified a number of genomic regions and candidate genes but no causal gene. Ofthese genomic regions, both the long and short arm of chromosome 6 have consistently produced positive associations. This study was undertaken to examine the possible contribution of two candidate genes from chromosome 6 to schizophrenia and affective disorder, the serotonin 1B gene (HTRIB) from 6ql3 and NOTCH4 from 6p21.3. HTR1B is considered a candidate due to its autoregulatory role in the serotonin system while NOTCH4 is considered due to the neurodevelopmental nature of the diseases and the role it plays during brain development. Schizophrenia studies on the two genes involved the association of SNPs in a casecontrol study representing a sample from Southwestern Ontario and methylation analysis of the translational start using sodium bisulfite (which also included 31 regions of a human brain). The affective disorder studies on the two genes examined the same SNPs and methylation in an extended family. The results indicated that none of the 14 polymorphisms from HRTlB or NOTCH4 were associated with schizophrenia in the case-control sample. Further, these iii polymorphisms showed no association with affective disorder in the family based studies. Methylation analysis indicated that the translational start of HTRIB was completely unmethylated in the blood of all control and affected individuals for both diseases. NOTCH4 translational start analysis showed variable/partial methylation at -25C in both schizophrenia and affective disorder samples but was not associated to either disease. Variable/partial methylation was also observed at -25C in different brain regions which are known to have different levels of NOTCH4 expression.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,097
Score d'incertitude au seuil0,711

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,042
Tête enseignante GPT0,269
Écart entre enseignants0,226 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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