Analyses génétiques de restes humains mis au jour sur la plage de Cap-Desrosiers : pourrait-il s’agir des naufragés du Carricks of Whitehaven ?
Notice bibliographique
Résumé
AvertissementL'auteur de ce mémoire, de cette thèse ou de cet essai a autorisé l'Université du Québec à Trois-Rivières à diffuser, à des fins non lucratives, une copie de son mémoire, de sa thèse ou de son essai.Cette diffusion n'entraîne pas une renonciation de la part de l'auteur à ses droits de propriété intellectuelle, incluant le droit d'auteur, sur ce mémoire, cette thèse ou cet essai.Notamment, la reproduction ou la publication de la totalité ou d'une partie importante de ce mémoire, de cette thèse et de son essai requiert son autorisation."Imagination is the discovering faculty, preeminently.It is that which penetrates into the unseen worlds around us, the worlds of science."-AdaLovelace REMERCIEMENTS Je tiens d'abord à remercier ma collègue et amie Kariane Larocque pour sa contribution significative et son support dans mon projet.Je remercie mon directeur de recherche, Dr Emmanuel Milot, et ma co-directrice, Dre.Isabelle Ribot, pour avoir concrétiser ce projet dans un domaine qui me passionne.Merci à ma co-directrice pour son apport des perspectives anthropologiques et archéologiques, de même que pour le temps investi pour des formations complémentaires et une introduction en archéologie.Je suis reconnaissante envers mon directeur d'avoir rendu possible un stage au Muséum National d'Histoire Naturelle à Paris.Ce stage est devenu une partie cruciale de mon développement professionnel et académique, j'en remercie chaleureusement les formateurs, José Utge, Paul Verdu et Céline Bon.Sans cet apport significatif, il aurait été impossible de mener à bien ce projet de recherche.Ma visite au Muséum a surpassé mes attentes et a également permis le développement de mon esprit critique notamment dans l'analyse des résultats qui nécessitent une attention toute particulière dans le domaine de l'ADN ancien.Je tiens à exprimer ma gratitude envers nos multiples partenaires : Jean-Christophe Grenier 1 , pour les analyses bioinformatiques et sa contribution pour l'interprétation subséquente.Merci à Alexandre Montpetit 2 et à son équipe pour leur contribution financière et la génération des séquences génétiques.Merci à Gianpiero Cavalleri 3 , Edmund Gilbert 3 , et son étudiante Ashwini Shanmugam 3 , pour nous avoir fourni l'accès à leur banque de données génétiques Irlandaises et pour avoir mener des analyses PCA.Merci à Diane Martin-Moya 4 pour sa contribution et son support dans la mise en place de protocoles.Merci à Hannes Schroeder du Globe Institute, Copenhague, pour le partage d'informations et les conseils en lien avec la mise en place et la sélection de protocoles 1 Bioinformaticien, institut de cardiologie de McGill 2 Directeur scientifique, Génome Québec 3 Collège royal de chirurgie, en Irlande 4 Archéologue candidate au doctorat, Université de Montréal iv iv adaptés à l'ADN ancien.Le projet n'aurait pu être possible sans l'apport interdisciplinaire de tous ces précieux partenaires.Je remercie le Groupe de recherche en science forensique (GRSF) pour avoir vu le potentiel de mon projet et pour leur soutien financier.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,003 | 0,004 |
| Études des sciences et des technologies | 0,005 | 0,002 |
| Communication savante | 0,003 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,014 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».