Can genomic tools aid conservation of an arctic seabird, the northern fulmar (Fulmarus glacialis)?
Notice bibliographique
Résumé
Human activities and climate change threaten Arctic ecosystems. Population genetics and genomics may help conservationists appropriately manage threatened species both by (1) determining the population genetic structure of a species, so that management can be designed to maximize conservation of genetic variation, and (2) enabling assessment of impacts on breeding populations of mortality during the nonbreeding season in migratory species. The northern fulmar (Fulmarus glacialis) is a seabird that breeds in colonies throughout the North Atlantic and Pacific Oceans. Though not currently considered at risk, several concerns, such as increased levels of toxins and ingested plastics, warrant investigation to aid conservation of northern fulmars. Up to 1% of the global population is killed annually through unintentional capture in commercial fishing activities, and northern fulmar survival appears to be negatively affected by climate change. As northern fulmars are migratory, the impact of these mortality sources on specific colonies is often unknown but may be important to inform management strategies. In this thesis, I use restriction site-associated DNA sequencing (RADseq) to provide 6614 genome-wide single nucleotide polymorphisms (SNPs) to investigate the genetic structure of the Atlantic northern fulmar, using 127 samples from six breeding colonies, one non-breeding location, and fishing activities in the Baffin Bay-Davis Strait region. I found weak genetic differentiation and suggest that Atlantic northern fulmar populations are genetically connected, experiencing high levels of gene flow. Determining the exact breeding origin of the bycatch birds was difficult due to the lack of differentiation between colonies. However, the birds appear to be from Arctic Canadian colonies, suggesting that the impact of the fisheries is on local colonies, and may be contributing to the 3% annual decline that has been observed at these locations.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,002 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».