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Enregistrement W7046133070

A comparison of gene expression by differential display in a salinomycin-sensitive and -resistant strain of Eimeria tenella

2000· dissertation· en· W7046133070 sur OpenAlexaboutno aff

Notice bibliographique

RevueThe Atrium (University of Guelph) · 2000
Typedissertation
Langueen
DomainePhysics and Astronomy
ThématiqueMagnetic confinement fusion research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésStrain (injury)SalinomycinDifferential displayEimeriaGene expressionNorthern blotGene
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In this study the differential display technique was used to identify differentially expressed genes between a salinomycin-resistant strain of ' Eimeria tenella' and the salinomycin-sensitive Guelph strain. The sporulated oocyst and sporocysts/sporozoites at various times during the process of excystation were used in the study. Since ionophorous compounds primarily affect the invasive sporozoite, this study focussed largely on this stage. Various bands were differentially displayed between the two strains and also during different stages and treatments within the same strain. Variation in individual species of mRNA were observed to occur in the mid to late stages of excystation. Additionally, a differentially amplified fragment was noted between sporozoites of the salinomycin-sensitive Guelph strain and the salinomycin-resistant strain subjected to treatment in PBS and salinomycin. Two cDNA fragments, found to be differentially displayed with the salinomycin-resistant strain of 'E. tenella' sporozoites incubated in PBS were isolated and cloned. Northern blot analysis revealed that the expression of a 1.5 kb fragment, appeared approximately 45 minutes into excystation and continued to be present throughout excystation. At the completion of excystation, the transcripts observed with the salinomycin-sensitive Guelph strain incubated in PBS were of higher molecular size (~1.35 and 1.15 kb) than when this strain was treated with salinomycin (~1.30 and 1.10 kb). The salinomycin-resistant strain incubated in PBS or treated with salinomycin each had two transcripts of approximately 1.30 and 1.10 kb. The expression rapidly declined in the salinomycin-resistant strain treated with salinomycin but the level of expression in the salinomycin-sensitive strain remained relatively constant.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,254
Écart entre enseignants0,243 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2000
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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