Development of statistical models for prediction of the neurotoxin domoic acid levels in the pennate diatom Pseudo-nitzschia multiseries utilizing data from cultures and natural blooms
Notice bibliographique
Résumé
Domoic acid (DA), a neurotoxin implicated in amnesic shellfish poisoning episodes, is produced by the pennate diatom Pseudo-nitzschia multiseries and its presence is associated with natural blooms of this marine microorganism. Laboratory studies indicate that production of the toxin by the diatom is related to physiological stress caused by limitation of nutrients, such as phosphate and silicate. This study attempts to develop predictive models of the amount of DA present, using data from laboratory physiological studies of the diatom, and from a combination of the laboratory data with field data from one Atlantic and two Pacific Ocean sites between 1988 and 1998. Such models can provide early warning of a potential poisoning episode without the sophisticated chemical determinations of domoic acid and avoid delays due to lack of analytical facilities and expertise. Predictor variables include nutrient ratios and cell abundance of Pseudo-nitzschia multiseries, determinations of which are both simple and inexpensive. Both linear and logistic regression methods are employed. Natural logarithm and square root transformations of predictors and response variables are needed to linearize the modeled relationship. In total, four models are proposed. Three of these models have r 2 ranging between 0.60 to 0.80 and are based on between four and seven predictors. Split sample reliability testing indicated that shrinkage on cross-validation for one of these models was below 35%. The fourth, a logistic regression model developed using the split-sample approach, has 2 predictors. In the training data, the prediction sensitivity and specificity of this model were approximately 76%. In the Validation data, the specificity increased to 87%, while the sensitivity declined to 67%.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,006 | 0,011 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,002 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».