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Enregistrement W7046762915

E3HistoneLASU1, a 500 kDa novel multi-functional ubiquitin protein ligase

2006· dissertation· en· W7046762915 sur OpenAlexfundno aff

Notice bibliographique

RevueeScholarship@McGill (McGill) · 2006
Typedissertation
Langueen
DomainePhysics and Astronomy
ThématiqueMagnetic confinement fusion research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchMcGill University
Mots-clésUbiquitinUbiquitin ligaseUbiquitin-conjugating enzymeHistoneChromatinCytoplasmUbiquitinsHistone H2A
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

During spermatogenesis histones must be degraded in late round and early elongating spermatids to permit chromatin condensation. Ubiquitin conjugation is activated and histones are ubiquitinated at this stage, suggesting that histone degradation may be mediated by ubiquitination. The activation of ubiquitin conjugation during spermatogenesis is dependent on the ubiquitin conjugating enzyme (E2) UBC4. We therefore studied whether histones are ubiquitinated by a UBC4 dependent ubiquitin protein ligase (E3) during spermatogenesis. E3Histone was identified by a biochemical screen and purified to near homogeneity. Mass spectrometry identified E3Histone as LASU1, a 482 kDa HECT domain protein and E3Histone conjugates ubiquitin to all core histories in vitro. UBC4-1 and UBC4-testis were the preferred E2s for E3Histone-dependent ubiquitination of histones. E3Histone was the major UBC4-1 dependent histone ubiquitinating E3 in testis. Anti-LASU1 antibody immunodepleted E3 Histone activity. Immunohistochemistry showed that E3Histone /LASU1 was predominantly expressed in nuclei from spermatogonia to mid-pachytene cells, but not detectable in spermatids. Histones are also ubiquitinated in spermatocytes. E3Histone/LASU1 was widely expressed in different mouse tissues. It was mainly expressed in the cytoplasm in most tissues, except in neurons of the brain and in early germ cells of the testis where it was expressed in the nucleus. In most tissues, E3Histone/LASU1 was expressed in epithelia. The wide expression of E3Histone/LASU1 suggests the existence of substrates of this E3 other than histones. Indeed, our assays showed that in vitro purified E3Histone stimulates polyubiquitination of Mcl-1, a BH3 region containing antiapoptotic protein. E3Histone may therefore regulate cell apoptosis by mediating degradation of Mcl-1. Since E3Histone/LASU1 was found previously to affect gene transcription and histone monoubiquitination is known to regulate gene transcription, we also evaluated the role of E3 Histone/LASU1 in histone ubiquitination in somatic cells. Depletion of E3Histone/LASU1 protein by siRNA did not affect the levels of free or ubiquitinated histories. In summary, E3Histone /LASU1 is a novel multi-functional protein that may mediate histone ubiquitination during meiosis and may be involved in apoptosis by triggering Mcl-1 degradation. Its wide expression and large non-catalytic region indicate that there are likely many other substrates of E3Histone/LASU1.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,251
Écart entre enseignants0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2006
Routes d'admission1
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