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Enregistrement W7046984672

Environmental impacts on clinical outcomes and the epigenome in patients with fibrotic interstitial lung disease

2023· article· en· W7046984672 sur OpenAlexaboutno aff

Notice bibliographique

RevueD-Scholarship@Pitt (University of Pittsburgh) · 2023
Typearticle
Langueen
DomainePhysics and Astronomy
ThématiqueMagnetic confinement fusion research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCohortBiobankInterstitial lung diseaseDiseaseEpigenomeOdds ratioEpigenomicsAdverse effectPulmonary function testing
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Fibrotic interstitial lung diseases (fILDs) are a group of conditions characterized by lung scarring, functional limitation, and a high morbidity and mortality. Air pollution and socioeconomic disadvantage have been linked with adverse outcomes in idiopathic pulmonary fibrosis (IPF), the most common form of fILD, but these impacts have not been evaluated in large, geographically-diverse cohorts of patients with fILD. This dissertation sought to evaluate the impact of particulate matter with a diameter of <=2.5um (PM2.5) and neighborhood-level disadvantage on clinical outcomes, genomic, and epigenomic mechanisms of disease in a diverse cohort of patients with fILD. Aim 1 demonstrated that patients with fILD who live in neighborhoods with greater disadvantage in the U.S., but not Canadian cohort, experience increased mortality and lower odds of receiving lung transplant. This work highlights how health disparities may be exacerbated by healthcare system structure, and raises questions of how environmental factors in disadvantaged neighborhoods contribute to these adverse outcomes. Aim 2 demonstrated that increased exposures to PM2.5 and its anthropogenic constituents (particularly sulfate, nitrate, and ammonium) are associated with increased mortality and worse lung function in fILDs. Aim 3 demonstrated that PM2.5 and its constituents can influence DNA methylation (DNAm) patterns and telomere length in patients with fILD, and that these molecular changes may mediate PM2.5-mortality associations. We found that increased PM2.5, sulfate, and ammonium exposures were associated with higher global DNAm using an ELISA-based assay. Then, epigenome-wide association studies identified multiple CpGs associated with high exposures to PM2.5. Most significant CpGs were found in analyses of sulfate, ammonium, and sea salt PM2.5 constituents, highlighting the potentially greater mechanistic relevance for these components of the PM2.5 mixture. Lastly, we found that higher exposure to PM2.5 and anthropogenic constituents was associated with shorter telomere length, which mediates a portion of the PM2.5-mortality association. By highlighting environmental impacts on clinical outcomes and molecular mechanisms of disease, we have unveiled potential causal pathways for how such exposures contribute to the development and progression of fILDs. This research has direct impacts on public health by providing critical data to inform environmental health policies that protect vulnerable populations.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,018
Score d'incertitude au seuil0,995

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,249
Écart entre enseignants0,236 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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