Elucidating the effects of miR-17˜92 on the metabolic program of B-cell lymphoma
Notice bibliographique
Résumé
Dysregulation of microRNAs is commonly observed in cancer cells.The polycistronic microRNA cluster, miR-17~92, is a known oncogene.Elevated expression of this miRNA cluster correlates with tumor aggressiveness in Eµ-Myc lymphomas.Our lab has identified Stk11 (which encodes the tumour suppressor gene LKB1) as a target of the miR-17 seed family that alters the metabolism of lymphoma cells.However, the mechanism by which the entire miR-17~92 cluster promotes cancer has yet to be fully elucidated.We hypothesized that miR-17~92 can promote cancer by altering the metabolism of tumour cells by modulating LKB1mediated suppression of mTOR signaling.To test this hypothesis, I used isogenic Eµ-Myc driven B-cell lymphoma cell lines overexpressing miR-17~92, which mimics the amplification of the miR-17~92 gene often observed in human cancer.In my work I showed that overexpression of miR-17~92 induces a bioenergetic shift in lymphomas, marked by an increase in OXPHOS, glycolysis, overall ATP production and mitochondrial DNA content.Lymphoma cells overexpressing miR-17~92 showed upregulation of downstream targets of the mTOR pathway, which modulates the translation of several metabolic genes and could account for the metabolic reprogramming observed.I observed that while there was no difference in transcriptional expression of some anabolic genes in mir-17~92 overexpressing cells, miR-17~92 resulted in increased protein expression of anabolic pathways like fatty acid synthesis and serine biosynthesis.Thus, polysome profiling was done to assess the levels of translation in these lymphomas.I observed enhanced translation of mRNAs from these pathways in miR-17~92 overexpressing cells.The serine biosynthesis pathway is a key metabolic pathway for rapidly dividing cells that provides building blocks for protein, nucleotide and lipid synthesis.I show that shRNA-mediated silencing of Phgdh, the first enzyme of the serine biosynthesis pathway, in lymphomas significantly decreases the growth of lymphoma cells overexpressing
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».