The epigenetic mechanism involved in MBD2-mediated induction of interleukin-33
Notice bibliographique
Résumé
Il-33, the most recently discovered member of the il-1 family of cytokines, is mainly expressed by fibroblasts, epithelial cells, and endothelial cells and signals via the ST2 receptor to promote Th2 type immune responses. This newly discovered cytokine has a well established role in airways inflammation, most notably asthma, and is involved in a wide range of diseases such a s atherosclerosis and atopic dermatitis, but its role in cancer remains unknown. Previous studies in our lab have demonstrated that expression of ectopic MBD2 transforms mouse fibroblasts NIH3T3 cells into highly invasive metastatic cancerous cells. Il-33 is the top gene induced by upregulation of the putative DNA demethylase MBD2 suggesting an undiscovered role of this new cytokine in tumorigenesis. The aim of this thesis is to assess the mechanisms underlying MBD2-mediated induction of il-33. We identify here using high-density tiling arrays with a combination of mDIP and ChIP-on-chip a regulatory region of il-33 which is partially demethylated by increasing the levels of methylated DNA binding protein domain 2 (MBD2) in the cell. Luciferase reporter assays confirm that this region bearing promoter activity is silenced upon in vitro methylation as well as show MBD2-dependent activation of a reporter gene. We further demonstrate using bisulfite pyrosequencing that similar methylation patterns are observed in murine tissues and cell types expressing il-33. Taken all together, our data suggest that il-33 is silenced by DNA methylation and activated by MBD2 triggering cell transformation and invasion. Thus, the new mechanism of il-33 regulation discovered in our studies might have important therapeutic implications in cancer growth and metastasis.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».