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Enregistrement W7047602273

Genetic epidemiological aspects of obesity and related traits. Human studies in Swedish and North-American cohorts

2006· dissertation· en· W7047602273 sur OpenAlexaboutno aff

Notice bibliographique

RevueGothenburg University Publications Electronic Archive (Gothenburg University) · 2006
Typedissertation
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueWater Quality Monitoring and Analysis
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésObesityGenetic epidemiologyPopulationEpidemiologyPedigree chartProbandFrameshift mutationMetabolic syndrome
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Aims: To investigate two obesity candidate genes, the melanocortin-4 receptor (MC4R) and the adiponectin hormone (APM1), by screening their genomic sequences. To search the human genome for quantitative trait loci (QTLs) related to resting metabolic rate (RMR), and respiratory quotient (RQ). To investigate whether the aetiology of the obesity epidemic might have a genetic component via assortative mating for obesity.Methods: The coding and flanking sequence of MC4R was screened in a total of 433 Whites and 96 Blacks (94% females) obese and normal-weight subjects from the Swedish Obese Subjects (SOS) study, the HERITAGE Family Study, and a Memphis cohort. The translated exons and part of intron 2 of APM1 was sequenced in 96 obese and 96 normal-weight Swedish women from the SOS study. Regression-based and variance-components-based genome-wide autosomal scans on RMR and RQ phenotypes, obtained from indirect calorimetry, were performed in 169 families ascertained to the Quebec Family Study via an obese proband or from the general population. Measured and validated questionnaire data on family members from 7834 obese Swedish probands, and from 829 subjects randomly ascertained from the general Swedish population were available for analysis.Results: Twelve missense MC4R mutations were detected. None of them were associated with obesity phenotypes. Moreover, two heterozygous deletions were found in two obese women: a 65_ 64delTG mutation, and a 171delC frameshift mutation, predicted to result in a truncated non-functional receptor. Three previously know APM1 variants were found in equal frequencies among obese and controls. Among them, T45T and G276G were associated with features of the metabolic syndrome in obese carriers. Evidence for linkage to RMR was detected on chromosomes 3q26.1 (LOD = 2.74), 1q21.2 (2.44), and 22q12.3 (1.33). QTLs influencing RQ were found on 12q13 (1.65) and 14q22 (1.83). Considerable locus heterogeneity within this population was suggested, as the majority of families were unlinked to any one QTL. Spouse correlations in body mass index (BMI) were strongest among couples with the shortest duration of cohabitation, suggesting assortative mating. Obesity concordance in parents was associated with an obesity prevalence of 20.1% in adult offspring, compared to 1.4% if parents were concordantly non-obese (odds ratio (OR): 18.3, 95% confidence interval: 9.0 37.4). No association was found between rearing parents and non-biological offspring s BMI.Conclusions: Pathogenic mutations in the MC4R are rare in the general obese population. Synonymous and intronic APM1 variants may influence components of the metabolic syndrome in obese carriers. All three RMR linkages overlapped regions previously linked to the metabolic syndrome, and a significant association between RMR and the metabolic syndrome found in the present cohort reinforces this relationship. The QTL on 1q21 may be a replication of one previously reported. Assortative mating for obesity confers a higher risk for obesity in the offspring generation and may therefore contribute to the obesity epidemic. Parental obesity concordance is a strong, easily identifiable genetic risk factor that should be considered in designing primary prevention programs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,980
Score d'incertitude au seuil0,040

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,239
Écart entre enseignants0,223 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2006
Routes d'admission1
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