HIV-1 DNA as a prognostic marker of immune reconstitution and clinical outcome in patients initiating antiretroviral therapy for the first time
Notice bibliographique
Résumé
Objective: This dissertation aims to evaluate the pre-cART HIV DNA burden as a predictive factor for immune reconstitution and clinical progression of the neurocognitive status of people living with HIV (PLWH). Methods: HIV DNA was isolated from peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) and quantified using real-time PCR. Immune reconstitution was assessed over a period of up to four years. Piecewise-linear mixed models were used to describe changes in CD4 counts. The Montreal Cognitive Assessment (MOCA) scale was used to evaluate cognitive function. Results: In the immune reconstitution study, 148 PLWH were included. The highest rate of immune reconstitution was observed during the first trimester of therapy. There was a trend suggesting that higher HIV RNA levels were associated with a greater increase in CD4 counts, particularly during the first trimester of cART (difference above vs. below median: 15.1 cells/μL/month, 95% CI: -1.4 – 31.5, p = 0.073). Similarly, higher HIV DNA levels appeared to predict greater CD4 increases, particularly after the first trimester (difference above vs. below median: 1.2 cells/μL/month, 95% CI: -0.1 – 2.6, p = 0.071). The combination of high HIV DNA and RNA levels was significantly associated with a greater CD4 increase after the first trimester (difference high/high vs. low/low: 2.1 cells/μL/month, 95% CI: 0.3 – 4.0, p = 0.024). In multivariable analysis, lower baseline CD4 counts predicted a greater CD4 increase.In the cognitive assessment study, 116 virally suppressed PLWH participated (mean age: 47.6 years, 91.4% male). Of these, 60 individuals underwent re-evaluation after the COVID-19 pandemic, with a median follow-up of 3.1 years. The median MOCA score was 24 (22–26), with 35.3% of participants scoring within normal limits. A negative correlation was observed between MOCA scores and age (ρ = −0.283, p = 0.002), but not with CD4 count at diagnosis (ρ = 0.169, p = 0.071) or initial HIV RNA load (ρ = 0.02, p = 0.984). In the subgroup of participants with repeated assessments, MOCA scores were correlated with CD4 counts (ρ = 0.238, p = 0.069 in the first and ρ = 0.319, p = 0.014 in the second test). An improvement in performance was observed, with an increase in the median MOCA score from 24 to 25 (p = 0.02). Conclusions: In PLWH receiving successful treatment, pre-cART HIV DNA and HIV RNA levels serve as predictive markers of immune reconstitution. The MOCA scale can detect early changes in cognitive function in PLWH. Neurocognitive decline is associated with age and possibly CD4 levels at the time of testing, but not with baseline CD4 counts or HIV RNA or DNA levels.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».