INVESTIGATION OF RECOVERY FOLLOWING SARS-COV-2 INFECTION: CLINICAL DISEASE, PATHOGENESIS, AND IMMUNE DURABILITY
Notice bibliographique
Résumé
SARS-CoV-2 continues to present unique challenges to global health as a proportion of \npeople recovering from COVID-19 deal with prolonged symptoms and the threat of re-infection \nwith antigenically divergent variants. Throughout my three project objectives, I address the \nunknowns of SARS-CoV-2 recovery utilizing both preclinical and clinical studies of COVID-19 \nrecovery addressing post-acute sequelae of COVID-19 (PASC) and immune durability. In \nObjective 1, Syrian hamsters were infected with SARS-CoV-2 and sampled over one-year to \nassess viral load, pathology, antibody levels, and gene expression profiles by RNA sequencing. \nLong-term analysis of infected hamsters indicated persistent SARS-CoV-2 RNA and protein \nmonths after acute infection, prolonged lung damage, sustained complement activation pathways\nand neutrophils present in the lungs, along with dysregulation of serotonin secretion genes in the \nbrain of previously infected hamsters. In Objective 2, I investigated the clinical characteristics \nand systemic immune profiles of individuals recovering from COVID-19 using a cross-sectional \nstudy in humans. Participants were recruited across five groups including those with and without \nPASC from the Saskatoon area to provide information on their COVID-19 experience and \nprovide a blood sample. Antibody responses were assessed by ELISA and viral neutralization \nassays, and cytokine profiles were determined by Ella SimplePlex Immunoassay. Individuals \nwith PASC had decreased levels of neutralizing antibodies toward SARS-CoV-2 and Omicron \nBA.1. Sex analysis indicated that female PASC participants had sustained inflammatory \ncytokines such as GM-CSF following COVID-19 while males had decreasing concentrations \nover time. Lastly, in Objective 3, I utilized homologous variant re-inoculations in C57Bl6/J mice \nusing the Alpha variant of SARS-CoV-2 to understand the durability of long-term immunity at \nchallenge. Mice were protected from re-infection at both day 21 and 56 post-primary infection. \nHowever, by day 84 mice were susceptible to re-infection indicating decayed protective immune \nresponses. Overall, key attributes of recovery after SARS-CoV-2 infection were identified \nincluding viral antigen persistence, prolonged lung damage, dysregulated immune responses, sex \ndifferences, and decaying protection from re-infection. Taken together, these findings may be \napplied to PASC diagnostic development, treatment evaluation, as well as public health policies \nand vaccine regimens for vulnerable groups with higher susceptibility to PASC.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».