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Enregistrement W7048145661

Investigating Interspecific Lentil Germplasm: Near-Infrared Spectroscopy for Protein and Amino Acid Contents and Quantitative Trait Loci Analyses

2024· dissertation· en· W7048145661 sur OpenAlexfundaboutno aff

Notice bibliographique

RevueUniversity Library (University of Saskatchewan) · 2024
Typedissertation
Langueen
DomainePhysics and Astronomy
ThématiqueSuperconducting and THz Device Technology
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCenters for Disease Control and PreventionUniversity of Manitoba
Mots-clésAmino acidQuantitative trait locusInterspecific competitionGenetic variationGenotypeAlleleInbred strainProline
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cultivated lentil (Lens culinaris Medik.) has a relatively narrow genetic base which poses many challenges to the improvement of the crop. Introgressing traits like biotic and abiotic stress resistance from wild relatives is often hindered by linkage drag of undesirable traits. Lentil is a nutritious staple crop, rich in protein, complex carbohydrates, vitamins, and minerals. This study aimed to investigate the effects of crossing with wild lentil on seed protein and amino acid contents. An interspecific recombinant inbred line (RIL) population, LR-68, generated from a cross between Lens culinaris and Lens orientalis was grown in four site-years in Saskatchewan, Canada. LR-68 was evaluated for protein and 18 amino acid contents using near-infrared (NIR) spectroscopy. Quantitative trait loci (QTL) analyses were then conducted to identify regions of the genome associated with protein and amino acid contents. LR-68 exhibited significant variation for protein and amino acid content, with protein content ranging from 24.9 to 34.9% on a dry basis. Protein and amino acid contents were highly correlated with each other. The correlations between protein content and days to flower, days to maturity, seed size, and seed shape were minor. Protein and amino acid contents were significantly affected by genotype, environment, and genotype by environment interaction. Genetic analyses revealed three QTL dense regions, with QTL for protein and multiple amino acids present at the same loci. At two of the three QTL dense regions, genotypes containing the allele from the wild parent, L. orientalis, had significantly higher protein and amino acid contents. Selecting for increased protein content when crossing with L. orientalis will also increase individual amino acid contents.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,017
Score d'incertitude au seuil0,034

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,245
Écart entre enseignants0,218 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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