Individuazione di fitoplasmi in colture di Monarda fistulosa L.
Notice bibliographique
Résumé
La monarda, nota anche come erba bergamotto (Monarda fistulosa L.), appartiene alla grande famiglia delle Lamiaceae; si tratta di una specie erbacea perenne originaria del Nord America, dalle foglie ovato-lanceolate ed i fiori riuniti in verticilli terminali di colore lilla o violetto. Possiede proprietà antisettiche, digestive ed antispasmodiche, ma può essere impiegata anche a scopo culinario (le foglie fresche rientrano nella preparazione di insalate, frittate, macedonie, tè aromatici, ecc.). Nel mese di luglio 2009 è stata osservata in un piccolo impianto di monarda allestito nel Giardino delle Erbe “Augusto Rinaldi Ceroni” di Casola Valsenio (Ravenna; Emilia-Romagna) una malattia tipicamente riferibile alla presenza di fitoplasmi. Il 50% delle piante presenti risultava colpito e presentava sintomi di nanismo, giallume fogliare, virescenza e malformazioni dei verticilli fiorali. Campioni fogliari sintomatici ed asintomatici sono stati prelevati e sottoposti alle analisi di laboratorio per individuare ed identificare i fitoplasmi eventualmente presenti. Dopo estrazione degli acidi nucleici mediante un metodo che prevede l’uso di cloroformio e fenolo, effettuata da 1 gr. di materiale floematico, è stata applicata la tecnica PCR sul gene ribosomico 16S. Dopo una reazione diretta effettuata utilizzando i primers P1/P7 è stato necessario eseguire una riamplificazione (‘nested’ PCR) dei prodotti ottenuti mediante i primers R16F2/R2, interni ai precedenti, per poter visualizzare in gel di agarosio gli amplificati della lunghezza attesa (1.200 nucleotidi). Sono quindi state effettuate analisi del polimorfismo della lunghezza dei frammenti di restrizione (RFLP) su questi amplificati con gli enzimi TruI, TaqI e Tsp509I per 16 ore a 65°C. La comparazione dei profili di restrizione ottenuti dai campioni di monarda con quelli ottenuti dall’amplificazione di ceppi di fitoplasmi già classificati, non ha permesso di identificare i fitoplasmi presenti come ascrivibili a nessuno dei gruppi finora descritti sia dopo amplificazione reale, sia ottenuti dalla restrizione virtuale di sequenze depositate in banca-dati. Ulteriori indagini mediante il sequenziamento degli amplificati e l’uso di ulteriori enzimi di restrizione sono in corso per verificare la posizione tassonomica del nuovo fitoplasma, necessaria per poterne studiare l’epidemiologia ed in particolare per individuarne i vettori in campo. Malattie associate a fitoplasmi sono state già descritte in specie appartenenti al genere Monarda, in particolare in Canada. Qui alla fine degli anni novanta, fitoplasmi del gruppo 16SrI-B (giallume dell’astro, Aster yellows (AY) sono stati identificati in coltivazioni di M. fistulosa con sintomatologie simili a quella riscontrata in Italia. Nel nostro Paese questa rappresenta comunque la prima segnalazione di fitoplasmosi in questa specie.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».