Low acid detergent lignin oat hull: molecular marker development and chromosome location
Notice bibliographique
Résumé
Selection for low acid detergent lignin (ADL) hull is one way to significantly improve the feed quality of oat for ruminants. Low ADL hull in the variety AC Assiniboia was reported by Thompson et al. (2000), and subsequent research indicated that the low ADL trait was simply inherited (Williams et al. 2002). The simple inheritance and difficult phenotypic evaluation make this trait an excellent candidate for molecular marker-assisted selection (MMAS). A population of 103 recombinant inbred lines was created from the cross between AC Assiniboia and the normal ADL breeding line OT775 (from the AAFC Lacombe oat R&D program). The population was grown in replicated field trials at Saskatoon in 2000 and 2001. % ADL was determined using an ANKOM200 fiber anaylser. Molecular marker analysis was performed using bulked-segregant DNA and Random Amplified Polymorphic DNA techniques. Random primer OPD15 (CATCCGTGCT) amplified a 1020 bp fragment from DNA of normal ADL lines only and is loosely linked (~ 24 cM) in repulsion with the low ADL trait. The same polymorphic fragment maps to linkage group 24_26_34 (Kanota/Ogle) between loci cdo353a and re2M2_12x. In the test population, low ADL lines were associated with brown hull colour. This relates well with a hull-colour locus located on the same linkage group approximately 30 cM from OPD15. Mapped markers in this region are being tested for tighter linkage with low ADL, and may be converted to PCR-based markers for MMAS. RFLP marker cdo373, which is close to the mapped hull-colour locus and ~25 cM from low ADL, has been isolated and sequenced from both low and normal genotypes. Conversion of this marker, and/or others, to PCR-based markers for MMAS is in progress. Thompson et al. 2000. Canadian Journal of Animal Science 80:377-379; Williams et al. 2002. In: Proceedings (CD-ROM) of the Soils and Crops Workshop, Univ. of Saskatchewan, Saskatoon, SK, Canada. March 2002.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,047 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».