Metabolite variation in ecologically diverse black cottonwood, Populus trichocarpa Torr. & A. Gray
Notice bibliographique
Résumé
Black cottonwood (Populus trichocarpa Torr. & A. Gray) is mass productive tree species native to the Pacific Northwest of North America. Gas chromatography - mass spectrometry was used to study the metabolic profiling of leaves from multiple genotypes to investigate the presence of clinal trends in metabolite levels and to determine if relationships with geo-climatic variables and date of bud set exist. In the late summer (September 3rd) of 2008, young leaves were collected from the species’ range and represented by 106 clones grown in a common garden established in Vancouver, British Columbia, Canada. The results validity was verified through the use of two independent canonical correlation analyses (CCA) that were performed on the intensity of the detected 104 compounds, including 40 known metabolites. Principle Component Analysis (PCA) was performed for original variables reduction and to determine the principle components accounting for most of the variation (the first ten PCAs accounted for 63% of the variation). The first analysis utilized the metabolites associated with the first ten principal components to determine the relationship between the original metabolites and geography, climate and date of bud set, while the second was based on the first ten principal components themselves. Both analyses yielded strong to moderate trends but the correlations (ranging from 0.45 to 0.97) were not statistically significant most likely due to the small sample size used. Based on the analyses conducted, it appears that P. trichocarpa ecotypes are preconditioned to suite their location-origin and the observed differences in metabolites reflected the genotypic variability among the studied trees.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».