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Enregistrement W7048988067

A multifaceted approach to elucidating the role of BRCA1- and BRCA2- related genes in hereditary breast cancer

2010· dissertation· en· W7048988067 sur OpenAlexaboutno aff

Notice bibliographique

RevueeScholarship@McGill (McGill) · 2010
Typedissertation
Langueen
DomainePhysics and Astronomy
ThématiqueAstronomy and Astrophysical Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPALB2CHEK2Breast cancerGermlineAlleleGenetic predispositionGermline mutationGeneMutation
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

5-10% of hereditary breast cancer cases are caused by germline mutations in well-defined, dominantly acting susceptibility genes such as BRCA1 and BRCA2. However, more than 50% of the genetic predisposition to hereditary breast cancer remains unexplained. In the following thesis, we present a multifaceted approach aimed at further elucidating hereditary breast cancer associated with BRCA1 and BRCA2 interacting genes; specifically, by analyzing the potential contribution from of two previously unscreened BRCA1-associating genes, RAP80 and Abraxas, assessing the presence and risk associated with CHEK2 susceptibility alleles in the previously uninvestigated French Canadian population and by investigating molecular and cellular mechanisms underlying the increased risk associated with PALB2 susceptibility alleles. A combination of genotyping 96 BRCA1/2 negative, high risk breast cancer patients and segregation analysis was utilized in the determination of whether or not RAP80 and Abraxas are breast cancer susceptibility genes. The contribution of CHEK2 associated breast cancer amongst the French Canadian population was determined through the genotyping 25 BRCA1/2 negative, high risk breast cancer and a cohort of 25 controls. Finally, the biological significance of four PALB2 susceptibility alleles was investigated through the use of the cellular cytotoxicity assay WST-1, telomere specific Q-FISH, centromere specific FISH and spectral karyotyping. The results presented herein suggest that both RAP80 and Abraxas are not high to moderately penetrant breast cancer susceptibility genes. Further, our results suggest that alleles other than the CHEK2 1100delC are unlikely to significantly contribute to the hereditary breast cancer risk in the French Canadian population. Lastly, the results obtained throughout our analysis of PALB2 heterozygous cell lines may be suggestive of a possible chromosomal instability phenotype predisposing carriers to additional tumourgenic mechanisms.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,017
Score d'incertitude au seuil0,034

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,245
Écart entre enseignants0,237 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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